More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5075 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 326 aa  670    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  77.16 
 
 		 324 aa  521  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2276  octaprenyl-diphosphate synthase  67.91 
 
 		 326 aa  436  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  63.99 
 
 		 311 aa  415  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  63.61 
 
 		 326 aa  415  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  62.5 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6988  Trans-hexaprenyltranstransferase  65.09 
 
 		 321 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955894  hitchhiker  0.000428726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0545  Trans-hexaprenyltranstransferase  63.24 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  53.42 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  50 
 
 		 324 aa  343  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  50 
 
 		 324 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  47.83 
 
 		 324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  48.14 
 
 		 324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  49.38 
 
 		 324 aa  326  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  47.83 
 
 		 324 aa  325  8.000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  48.45 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0775  hypothetical protein  38.8 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  36.39 
 
 		 332 aa  229  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  37.22 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  38.08 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1998  polyprenyl synthetase  39.29 
 
 		 292 aa  225  6e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.553605 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  36.81 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  35.87 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  36.83 
 
 		 322 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 322 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  35.44 
 
 		 322 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  36.48 
 
 		 322 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  36.84 
 
 		 332 aa  212  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.33 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  36.5 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  35.22 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.39 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  35.22 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  35.49 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  36.53 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  35.6 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  36.94 
 
 		 322 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  33.97 
 
 		 322 aa  205  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  36.94 
 
 		 322 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  35.38 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  36.94 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  35.19 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  35.19 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  36.51 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  36.62 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  34.69 
 
 		 333 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  34.67 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.95 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  35.38 
 
 		 348 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  34.66 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.88 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  35.35 
 
 		 322 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  35.99 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  35.35 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  36.92 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  33.44 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  37.14 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  34.26 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  35.67 
 
 		 322 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.63 
 
 		 323 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  34.46 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  34.04 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  34.04 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  35.03 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  34.14 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  33.23 
 
 		 323 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  34.46 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  35.71 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  34.73 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.76 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  34.15 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  35.74 
 
 		 360 aa  192  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  33.64 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  33.64 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  33.64 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  36.39 
 
 		 322 aa  192  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  37.03 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  33.64 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.47 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  32.81 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  37.75 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  33.23 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  34.39 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  37.14 
 
 		 325 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  34.11 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  35.14 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  33.02 
 
 		 323 aa  190  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  33.54 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  35.6 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  32.3 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  33.97 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  32.72 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.16 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  33.97 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  33.54 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.61 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  34.25 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  32.41 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>