More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3893 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
257 aa  532  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  74 
 
 
258 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  64.98 
 
 
257 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  60.48 
 
 
252 aa  323  1e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  55.2 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  56.18 
 
 
255 aa  300  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  48.61 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  48.4 
 
 
254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  49.59 
 
 
254 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  48.19 
 
 
263 aa  262  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  49.13 
 
 
234 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  44.67 
 
 
285 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
296 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
290 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 
287 aa  95.9  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
340 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
340 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
345 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
299 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
290 aa  92.8  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
285 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
285 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
285 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 
284 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
329 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
291 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
339 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 
315 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
308 aa  85.1  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  23.99 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.1 
 
 
370 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
287 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
256 aa  82  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  25.29 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.95 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  24.01 
 
 
289 aa  78.6  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.31 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.519861  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.11 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.49 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  29.74 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  25.82 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.25 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.25 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.25 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.2 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  28.25 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.25 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.25 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  23.02 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  22.38 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.81 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.84 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  25 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.17 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.17 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>