More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2099 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  69.79 
 
 		 528 aa  764    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  64.17 
 
 		 544 aa  715    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 547 aa  1138    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.51 
 
 		 543 aa  679    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  81.34 
 
 		 552 aa  961    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  65.08 
 
 		 542 aa  760    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.15 
 
 		 546 aa  786    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.04 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.44 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.8 
 
 		 503 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  39.8 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.31 
 
 		 498 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.91 
 
 		 523 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.21 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.8 
 
 		 522 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.54 
 
 		 517 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  41.16 
 
 		 505 aa  368  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.76 
 
 		 495 aa  362  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  39.84 
 
 		 513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.39 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.09 
 
 		 505 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.09 
 
 		 505 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.88 
 
 		 505 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.71 
 
 		 504 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.3 
 
 		 504 aa  340  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.37 
 
 		 488 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.5 
 
 		 507 aa  307  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.71 
 
 		 477 aa  292  8e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.19 
 
 		 479 aa  249  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.57 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.99 
 
 		 478 aa  230  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  29.04 
 
 		 489 aa  194  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.86 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.38 
 
 		 484 aa  186  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.05 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.49 
 
 		 479 aa  180  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.49 
 
 		 479 aa  180  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  29.49 
 
 		 488 aa  177  5e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.83 
 
 		 483 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  28.54 
 
 		 512 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.14 
 
 		 480 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  28.57 
 
 		 480 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.51 
 
 		 480 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.42 
 
 		 480 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  27.54 
 
 		 481 aa  170  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.69 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  27.18 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.77 
 
 		 480 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  28 
 
 		 477 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  28 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  28 
 
 		 477 aa  165  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  28 
 
 		 477 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  28 
 
 		 477 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  28 
 
 		 477 aa  165  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  28 
 
 		 477 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.6 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.51 
 
 		 481 aa  160  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.54 
 
 		 457 aa  160  6e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.43 
 
 		 478 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.24 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  26.86 
 
 		 477 aa  158  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  32.21 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  29.39 
 
 		 478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.27 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.67 
 
 		 473 aa  146  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.22 
 
 		 475 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.2 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.67 
 
 		 454 aa  125  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.85 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.56 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.27 
 
 		 458 aa  111  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.28 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  26.67 
 
 		 445 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.32 
 
 		 474 aa  106  9e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.5 
 
 		 458 aa  106  9e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.62 
 
 		 458 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.17 
 
 		 458 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.89 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.36 
 
 		 443 aa  104  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.52 
 
 		 491 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.57 
 
 		 456 aa  103  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.68 
 
 		 437 aa  103  9e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  24.49 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  25.34 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.39 
 
 		 483 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.44 
 
 		 482 aa  99  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.92 
 
 		 459 aa  98.6  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.43 
 
 		 458 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.5 
 
 		 482 aa  96.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  26.26 
 
 		 480 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  26.11 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.14 
 
 		 482 aa  94  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  26.26 
 
 		 480 aa  93.6  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.66 
 
 		 482 aa  93.2  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.61 
 
 		 462 aa  91.3  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.09 
 
 		 475 aa  90.9  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.38 
 
 		 443 aa  90.9  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.96 
 
 		 462 aa  90.9  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>