296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0564 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  100 
 
 		 607 aa  1253    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  67 
 
 		 616 aa  786    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  44.58 
 
 		 594 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  43.95 
 
 		 626 aa  472  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  41.34 
 
 		 592 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  38.53 
 
 		 598 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  39.83 
 
 		 594 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  41.28 
 
 		 431 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  34.89 
 
 		 571 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  34.38 
 
 		 613 aa  308  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3118  cytochrome C peroxidase  31.03 
 
 		 662 aa  231  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  35.95 
 
 		 768 aa  190  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  37.88 
 
 		 336 aa  186  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  34.68 
 
 		 365 aa  174  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  33.13 
 
 		 328 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  37.45 
 
 		 332 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  35.82 
 
 		 626 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  34.11 
 
 		 358 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  37.05 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  35.57 
 
 		 353 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  35.32 
 
 		 328 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  37.5 
 
 		 314 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  33.77 
 
 		 333 aa  163  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  38.1 
 
 		 346 aa  163  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  33.73 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  34.56 
 
 		 346 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  33.9 
 
 		 311 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  36.19 
 
 		 521 aa  161  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  35 
 
 		 398 aa  160  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  35.21 
 
 		 417 aa  160  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  36.33 
 
 		 334 aa  160  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  35.35 
 
 		 343 aa  157  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  34.01 
 
 		 335 aa  156  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  33.44 
 
 		 431 aa  153  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  34.8 
 
 		 459 aa  153  8e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  35.66 
 
 		 317 aa  153  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  34.35 
 
 		 330 aa  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  34.12 
 
 		 330 aa  151  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  36.09 
 
 		 357 aa  151  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  36.22 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  36.22 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  36.22 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  36.22 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  33.99 
 
 		 365 aa  148  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.83 
 
 		 465 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  35.37 
 
 		 333 aa  147  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  31.8 
 
 		 369 aa  147  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  33.56 
 
 		 302 aa  147  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  34.48 
 
 		 473 aa  146  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  35.83 
 
 		 465 aa  146  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  33.2 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  35.83 
 
 		 465 aa  146  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  33.2 
 
 		 344 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  33.2 
 
 		 344 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  33.2 
 
 		 344 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  32.89 
 
 		 346 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  35.09 
 
 		 346 aa  144  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  31.56 
 
 		 398 aa  144  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  32.68 
 
 		 464 aa  144  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  31.86 
 
 		 365 aa  144  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  37.4 
 
 		 343 aa  143  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  30.36 
 
 		 337 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  32.57 
 
 		 352 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  32.67 
 
 		 379 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  33.6 
 
 		 333 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  33.6 
 
 		 333 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  35.06 
 
 		 331 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  34.39 
 
 		 330 aa  142  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 		 459 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  32.14 
 
 		 368 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  33.43 
 
 		 360 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  30.06 
 
 		 373 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 		 459 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 459 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  33.2 
 
 		 333 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  33.2 
 
 		 333 aa  140  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  32.72 
 
 		 322 aa  140  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  32.68 
 
 		 358 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  31.27 
 
 		 352 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  32.96 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 		 352 aa  139  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  33.55 
 
 		 345 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  34.38 
 
 		 466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  33.11 
 
 		 349 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  35.57 
 
 		 371 aa  137  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  34.38 
 
 		 466 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  34.38 
 
 		 466 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  32.41 
 
 		 333 aa  137  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  34.38 
 
 		 466 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  34.38 
 
 		 466 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  31.27 
 
 		 352 aa  136  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  33.7 
 
 		 346 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  34.12 
 
 		 352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  33.58 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  32.09 
 
 		 352 aa  135  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  32.69 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  31.17 
 
 		 427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  33.22 
 
 		 348 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  32.45 
 
 		 345 aa  134  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  33.98 
 
 		 384 aa  134  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>