More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0729 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  90.56 
 
 		 417 aa  748    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  89.76 
 
 		 420 aa  734    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  100 
 
 		 420 aa  837    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  46.39 
 
 		 376 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  43.11 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  44.12 
 
 		 393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  44.12 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  41.38 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 		 409 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  38.23 
 
 		 401 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  37.75 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 403 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  36.52 
 
 		 389 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  38.36 
 
 		 418 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 403 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 392 aa  236  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  37.28 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  37.19 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 404 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  36.13 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  37.14 
 
 		 400 aa  230  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  35.6 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 400 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 403 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 406 aa  223  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  35.29 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  34.41 
 
 		 397 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.12 
 
 		 404 aa  219  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 402 aa  216  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 393 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  36.55 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 401 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  36.68 
 
 		 404 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 403 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  35.41 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  35.41 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  35.41 
 
 		 388 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  33.6 
 
 		 402 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  33.87 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  33.87 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  33.6 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  33.6 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  33.6 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  33.6 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 397 aa  159  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 379 aa  155  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  29.61 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  31.71 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 429 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  44.68 
 
 		 222 aa  130  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 398 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 382 aa  113  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0131  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00122667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  36.42 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0250  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 393 aa  87  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3105  major facilitator superfamily MFS_1  23.25 
 
 		 391 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>