More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2367 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2367  heme exporter protein CcmA  100 
 
 
236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1476  ATPase  54.25 
 
 
215 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0027067  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3131  ABC transporter related  56.74 
 
 
219 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.368318 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1944  ABC transporter related  56.07 
 
 
216 aa  198  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558495  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2507  heme exporter protein CcmA  51.43 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0983  ABC transporter related  43.46 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0112496  hitchhiker  0.000377854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  38.19 
 
 
303 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0983  ABC heme exporter, ATPase subunit  33.64 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2304  ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 
226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666895  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3354  heme exporter protein CcmA  35.85 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.366853 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2290  ABC transporter related protein  30.43 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  40 
 
 
301 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0236  ABC transporter related protein  36.68 
 
 
247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  35.89 
 
 
230 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  40 
 
 
318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03770  heme exporter protein CcmA  38.62 
 
 
212 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04340  ABC transporter related  34.74 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0537  ABC transporter related  30.26 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0682  ABC transporter related  32.18 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0680  heme exporter protein CcmA  36.22 
 
 
195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  35.89 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  37.13 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  36.02 
 
 
312 aa  112  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2582  ABC transporter related  32.85 
 
 
237 aa  112  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  35.58 
 
 
244 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2051  ABC transporter related protein  33.05 
 
 
262 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1411  heme exporter protein CcmA  41.49 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.772651  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  31.48 
 
 
250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3812  putative bacteriocin ABC transporter, ATP-binding protein  34.45 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3773  ABC transporter related  31.31 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  35.81 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1167  ABC transporter related  38.03 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  0.478862 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  30.83 
 
 
306 aa  109  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 
241 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.92 
 
 
316 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  31.68 
 
 
310 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  35.68 
 
 
318 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05000  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.18 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.977255  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  32.21 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  30.52 
 
 
311 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0030  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.84 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  33.49 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  35.78 
 
 
304 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  29.25 
 
 
297 aa  108  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4301  ABC transporter related  35.84 
 
 
401 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  34.45 
 
 
288 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  36.56 
 
 
332 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 
331 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  35.41 
 
 
310 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  35.35 
 
 
242 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  31.9 
 
 
240 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01807  ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 
240 aa  108  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  33.97 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  34.13 
 
 
309 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  37.62 
 
 
301 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  35.78 
 
 
287 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3616  bacteriocin ABC transporter ATP-binding protein  33.97 
 
 
234 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3903  bacteriocin ABC transporter ATP-binding protein  33.97 
 
 
234 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  36.71 
 
 
369 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  35.38 
 
 
496 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  37.8 
 
 
309 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0934  heme exporter protein CcmA  38.95 
 
 
209 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  31.22 
 
 
310 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 
241 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  33.98 
 
 
344 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 
309 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 
306 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  34.78 
 
 
313 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 
335 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  29.65 
 
 
245 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  33.18 
 
 
309 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
298 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  35.38 
 
 
314 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1952  ABC transporter related  36.28 
 
 
215 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  33.19 
 
 
288 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.16 
 
 
316 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  35.65 
 
 
316 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  32.7 
 
 
309 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  30.88 
 
 
248 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  36.7 
 
 
309 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 
248 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 
309 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  32.7 
 
 
309 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  32.21 
 
 
309 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  32.88 
 
 
396 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  32.57 
 
 
315 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  36.7 
 
 
309 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2001  ABC transporter related  33.17 
 
 
286 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  34.68 
 
 
398 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  29.19 
 
 
290 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4316  ABC transporter related protein  39.32 
 
 
254 aa  105  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991603  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  33.95 
 
 
326 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  36.55 
 
 
316 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04085  ABC transporter ATP-binding protein  33.17 
 
 
240 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  32.11 
 
 
231 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  33.95 
 
 
304 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  33.95 
 
 
373 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  31.31 
 
 
303 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  34.56 
 
 
310 aa  105  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>