More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1154 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1154  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
706 aa  1432    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.986646  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1421  putative PAS/PAC sensor protein  31.36 
 
 
687 aa  295  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.377844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1157  putative PAS/PAC sensor protein  33.13 
 
 
723 aa  286  8e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148223 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1974  putative PAS/PAC sensor protein  32.91 
 
 
701 aa  277  4e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0002  putative PAS/PAC sensor protein  30.16 
 
 
690 aa  268  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0637  putative PAS/PAC sensor protein  31.17 
 
 
716 aa  264  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0567  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 
693 aa  240  6.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1559  metal-dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 
698 aa  125  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000474129  normal  0.225702 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  30.59 
 
 
341 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  30.4 
 
 
474 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7735  metal dependent phosphohydrolase  42.2 
 
 
905 aa  114  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 
364 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0780  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.5 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0195559  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
320 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  34.54 
 
 
619 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 
465 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
960 aa  105  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
495 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  32.93 
 
 
650 aa  105  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.75 
 
 
746 aa  105  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  34.04 
 
 
212 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  38.83 
 
 
719 aa  103  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  30.28 
 
 
458 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  29.85 
 
 
452 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.08 
 
 
491 aa  103  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.66 
 
 
1338 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  28.24 
 
 
1335 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  36.93 
 
 
876 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.28 
 
 
853 aa  102  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
487 aa  101  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  37.57 
 
 
718 aa  101  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  36.67 
 
 
792 aa  101  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 
719 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  32.97 
 
 
320 aa  101  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5138  metal dependent phosphohydrolase  36.42 
 
 
306 aa  101  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174977  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  35.67 
 
 
649 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.57 
 
 
841 aa  100  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  34.64 
 
 
771 aa  100  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  37.37 
 
 
405 aa  99.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 
428 aa  100  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  35.2 
 
 
632 aa  99.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
387 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 
358 aa  99  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  35.58 
 
 
1171 aa  98.2  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  27.38 
 
 
359 aa  97.8  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 
438 aa  97.4  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  32.8 
 
 
1301 aa  97.1  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3816  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 
351 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0960158  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  35.03 
 
 
836 aa  96.7  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.11 
 
 
755 aa  97.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 
334 aa  97.1  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  26.43 
 
 
471 aa  97.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 
351 aa  97.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1678  putative PAS/PAC sensor protein  24.38 
 
 
625 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0321383  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  32.62 
 
 
509 aa  96.3  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0538  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 
363 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 
389 aa  95.9  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0261  metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 
245 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 
545 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  32.98 
 
 
334 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.32 
 
 
971 aa  95.9  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 
480 aa  95.5  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 
451 aa  95.1  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 
505 aa  95.1  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 
499 aa  94.7  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  32.51 
 
 
308 aa  94.7  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  35.19 
 
 
547 aa  94.4  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 
574 aa  94.4  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  35.19 
 
 
547 aa  94.4  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
357 aa  94.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  32.8 
 
 
334 aa  94.4  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 
1237 aa  94  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.54 
 
 
1073 aa  94  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  32.02 
 
 
357 aa  93.2  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  32.02 
 
 
350 aa  93.6  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
351 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 
331 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 
492 aa  92.8  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 
740 aa  92.4  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 
469 aa  92.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  27.92 
 
 
469 aa  92  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.14 
 
 
860 aa  91.7  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.14 
 
 
880 aa  92  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 
379 aa  91.3  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  35.03 
 
 
703 aa  91.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  34.27 
 
 
298 aa  91.3  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  36.9 
 
 
710 aa  90.9  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  31.84 
 
 
430 aa  90.9  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 
571 aa  90.9  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 
407 aa  90.9  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  31.52 
 
 
444 aa  90.9  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 
353 aa  90.9  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  33.52 
 
 
334 aa  90.5  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
384 aa  90.5  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 
220 aa  90.5  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  34.84 
 
 
389 aa  90.1  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  35.03 
 
 
703 aa  90.5  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0899  hypothetical protein  32.95 
 
 
294 aa  90.1  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000973065 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  37.85 
 
 
635 aa  90.5  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
506 aa  90.1  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>