More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5138 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5138  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
306 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174977  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0899  hypothetical protein  42.8 
 
 
294 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000973065 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  40.19 
 
 
632 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  40.31 
 
 
547 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  40.31 
 
 
547 aa  157  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
518 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.62 
 
 
331 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.62 
 
 
331 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  43.71 
 
 
452 aa  149  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  41.9 
 
 
876 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.72 
 
 
328 aa  148  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  40.68 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  42.49 
 
 
499 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  41.34 
 
 
505 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  43.72 
 
 
451 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  40.22 
 
 
465 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 
1073 aa  146  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 
506 aa  145  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  40.45 
 
 
387 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 
571 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  41.95 
 
 
481 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
389 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0150  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.16 
 
 
369 aa  143  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.51 
 
 
357 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
320 aa  142  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0206  metal-dependent phosphohydrolase  37.16 
 
 
369 aa  143  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  43.85 
 
 
545 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.86 
 
 
491 aa  142  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  36.1 
 
 
374 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  36.9 
 
 
599 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  39.01 
 
 
377 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  39.01 
 
 
373 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.07 
 
 
496 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  39.01 
 
 
377 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  39.01 
 
 
374 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  39.01 
 
 
373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 
495 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.35 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  40.5 
 
 
451 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.45 
 
 
378 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  42.77 
 
 
469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.64 
 
 
526 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  40.48 
 
 
713 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 
545 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  35.9 
 
 
770 aa  139  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.7 
 
 
363 aa  138  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  40.91 
 
 
349 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  41.01 
 
 
438 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  39.05 
 
 
371 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  43.26 
 
 
719 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  39.6 
 
 
718 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  36.45 
 
 
553 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  42.2 
 
 
836 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  39 
 
 
357 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.9 
 
 
513 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  43.68 
 
 
220 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.61 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  44.16 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.42 
 
 
880 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  42.7 
 
 
718 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.42 
 
 
860 aa  136  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  35.24 
 
 
1171 aa  136  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 
487 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  38.67 
 
 
467 aa  135  8e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  39.77 
 
 
350 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  36.97 
 
 
356 aa  135  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1613  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.32 
 
 
487 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350204  hitchhiker  0.000130728 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 
698 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  40.1 
 
 
460 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  41.24 
 
 
836 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  35.2 
 
 
563 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  43.26 
 
 
571 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2951  response regulator receiver protein  36.87 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  37.93 
 
 
712 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 
561 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  37.97 
 
 
474 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  39.66 
 
 
649 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  39.18 
 
 
1301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2945  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 
647 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 
407 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  38.55 
 
 
848 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.88 
 
 
502 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.34 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  39.27 
 
 
311 aa  132  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  38.94 
 
 
512 aa  132  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.48 
 
 
364 aa  133  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.07 
 
 
498 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.44 
 
 
508 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 
177 aa  132  6.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  35.06 
 
 
564 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 
461 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  40.36 
 
 
509 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 
461 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  43.71 
 
 
207 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  38.14 
 
 
359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.57 
 
 
841 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>