55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0759 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0759  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
187 aa  380  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2664  TPR repeat-containing protein  59.89 
 
 
187 aa  224  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2283  TPR repeat-containing protein  57.69 
 
 
186 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.976866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0357  TPR repeat-containing protein  56.76 
 
 
273 aa  209  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3025  TPR repeat-containing protein  52.75 
 
 
185 aa  187  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.21 
 
 
2401 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 
301 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  35.23 
 
 
295 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  35.23 
 
 
295 aa  56.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 
220 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
3145 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
1096 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 
833 aa  48.5  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
643 aa  48.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 
804 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  22.7 
 
 
682 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.82 
 
 
476 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  20.99 
 
 
467 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.35 
 
 
782 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
900 aa  45.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  31.82 
 
 
269 aa  44.7  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
377 aa  44.7  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.15 
 
 
875 aa  44.7  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  27.04 
 
 
690 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2117  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1444  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 
586 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.61 
 
 
561 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
268 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  27.98 
 
 
924 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26.61 
 
 
561 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
1116 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
593 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
543 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.54 
 
 
758 aa  42.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  25.56 
 
 
1013 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 
827 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 
409 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
866 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2020  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
243 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
594 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  30.85 
 
 
508 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0116  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 
207 aa  42  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03050  ubiquitin-protein ligase, putative  23.33 
 
 
773 aa  42  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 
615 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.7 
 
 
222 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0120  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
555 aa  42  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51724  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
750 aa  41.6  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0340  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.73 
 
 
298 aa  41.6  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 
589 aa  41.6  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.43 
 
 
293 aa  41.6  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
673 aa  41.2  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.12 
 
 
1154 aa  41.2  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
567 aa  41.2  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  26.36 
 
 
1009 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>