More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0690 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  100 
 
 		 452 aa  904    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  58.84 
 
 		 433 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  56.94 
 
 		 432 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  56.54 
 
 		 438 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  46.14 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  44.68 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  30.75 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  27.21 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  30.07 
 
 		 439 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  28.07 
 
 		 431 aa  186  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  27.99 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  28.95 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  32.03 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  29.86 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  29.86 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  30.97 
 
 		 428 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  29.53 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  33.72 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  26.35 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  27.68 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  29.52 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  26.88 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  27.52 
 
 		 430 aa  162  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  29.1 
 
 		 428 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.77 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  29.59 
 
 		 438 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  29.53 
 
 		 452 aa  161  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  28.18 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  29.63 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  28.21 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  28.11 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  26.56 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  29.74 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  28.44 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  28.44 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  28.44 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  28.44 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  28.44 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  28.31 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  28.31 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  28.31 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  28.31 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  28.31 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  28.31 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  28.31 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  28.31 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  27.8 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  29.72 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  27.97 
 
 		 434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  26.42 
 
 		 429 aa  156  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  28.47 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  27.39 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  27.39 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  30.19 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  27.48 
 
 		 435 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  28.07 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  28.05 
 
 		 446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  29.02 
 
 		 425 aa  153  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  29.02 
 
 		 425 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  29.02 
 
 		 425 aa  153  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  29.02 
 
 		 425 aa  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  29.02 
 
 		 425 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  29.02 
 
 		 425 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  27.29 
 
 		 436 aa  153  8e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  28.78 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  28.78 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  26.73 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  27.78 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  27.78 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  28.78 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  27.78 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  27.72 
 
 		 440 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  29.62 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  25.35 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  26.83 
 
 		 448 aa  151  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  27.42 
 
 		 544 aa  151  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  26.85 
 
 		 436 aa  150  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  27 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  27.31 
 
 		 471 aa  149  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  27.96 
 
 		 518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  28.17 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  28.33 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  27.55 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  27.51 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  28.41 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  28.94 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  28.38 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  28.43 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  28.61 
 
 		 463 aa  146  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  27.34 
 
 		 438 aa  146  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  28.18 
 
 		 478 aa  146  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  29.16 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  28.18 
 
 		 478 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  27.25 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  28.57 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  28.16 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  25.8 
 
 		 488 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  27.27 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  24.94 
 
 		 443 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  29.65 
 
 		 436 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>