105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0447 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 389 aa  784    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  74.81 
 
 		 387 aa  578  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  71.69 
 
 		 387 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  69.79 
 
 		 387 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  65.45 
 
 		 386 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  60.16 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  56.36 
 
 		 384 aa  451  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  54.57 
 
 		 384 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  54.15 
 
 		 385 aa  418  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  52.97 
 
 		 389 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  57.66 
 
 		 385 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  50.91 
 
 		 385 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  50.39 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  51.7 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  38.22 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  37.34 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  36.39 
 
 		 416 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  35.86 
 
 		 416 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2309  Polysulphide reductase NrfD  33.68 
 
 		 358 aa  186  8e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  29.62 
 
 		 391 aa  169  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  29.17 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  26.14 
 
 		 413 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  26.82 
 
 		 413 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  25.07 
 
 		 411 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  26.49 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  26.79 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  30.89 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  25.94 
 
 		 388 aa  103  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  24.8 
 
 		 442 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  29.24 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  27.65 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  25.37 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  27.07 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  27.06 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  27.65 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1944  polysulfide reductase, subunit C, putative  29.59 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  22 
 
 		 466 aa  69.7  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  23.54 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  24.23 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  23.88 
 
 		 593 aa  67  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  24.54 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  23.6 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  25.66 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  22.95 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  21.89 
 
 		 603 aa  62.4  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  23.39 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  25.13 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  22.96 
 
 		 624 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  21.61 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  23.2 
 
 		 624 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  23.4 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  24.7 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  26.48 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  20.64 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  20.84 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  22.61 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  23.79 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  21.64 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  24.34 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  22.3 
 
 		 456 aa  57  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  21.27 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  22.36 
 
 		 472 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  21.91 
 
 		 461 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  21.73 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  24.75 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  21.36 
 
 		 456 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  21.36 
 
 		 456 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  20.87 
 
 		 451 aa  52.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  22.44 
 
 		 476 aa  53.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  24.1 
 
 		 482 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  22.65 
 
 		 478 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  22.22 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  22.42 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  24.37 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  22.22 
 
 		 478 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  22.22 
 
 		 478 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  24.56 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  21.48 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  21.77 
 
 		 451 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  20.05 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  23.19 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  20.59 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  21.14 
 
 		 452 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  24.32 
 
 		 315 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  24.55 
 
 		 469 aa  46.6  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  22.22 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3735  polysulphide reductase NrfD  23.04 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3678  Polysulphide reductase NrfD  23.04 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  21.25 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  19.93 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  23.08 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  21.4 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  23.9 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  20.44 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3537  polysulphide reductase, NrfD  23.24 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1511  Polysulphide reductase NrfD  25.29 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  23.84 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  23.55 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  24.94 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0590  polysulphide reductase NrfD  22.55 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>