More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2189 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 383 aa  765    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  35.58 
 
 		 403 aa  206  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  38.21 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  37.42 
 
 		 401 aa  186  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  33.14 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  33.43 
 
 		 389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  34.01 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 378 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  25.85 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.34 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  33.77 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  29.87 
 
 		 374 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  32.47 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  31.15 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  31.61 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  30.77 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  30.74 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  28.79 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  30.57 
 
 		 398 aa  99.4  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  34 
 
 		 375 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  32.81 
 
 		 445 aa  97.4  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  32.74 
 
 		 434 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  31.43 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  30.36 
 
 		 362 aa  94  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.17 
 
 		 376 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  28.03 
 
 		 374 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 368 aa  93.6  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  32.92 
 
 		 409 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.85 
 
 		 384 aa  93.2  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.81 
 
 		 384 aa  93.6  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  29.49 
 
 		 413 aa  93.2  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.83 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  24.68 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  25 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  24.15 
 
 		 377 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  29.36 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  30.7 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  33.8 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  28.41 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.61 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.74 
 
 		 445 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  24.86 
 
 		 376 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.54 
 
 		 436 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.82 
 
 		 341 aa  86.3  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  30.79 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  29.27 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  30.53 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  30.53 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  30.93 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  32 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  29.79 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  31.09 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  30.48 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  32.99 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  30.32 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  25.39 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  26.53 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  23.98 
 
 		 455 aa  82.8  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.62 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  22.19 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.06 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  29.64 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.89 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  29.82 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.85 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  30.99 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  30.48 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  32.33 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.13 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.77 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  30.86 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.13 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.4 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  29.15 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.79 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  25.28 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 431 aa  76.3  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  30.72 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  24.62 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  29.56 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  32.98 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.5 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.75 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.91 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>