More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1387 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1387  ATPase  100 
 
 		 243 aa  502  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  78.6 
 
 		 243 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  78.69 
 
 		 246 aa  401  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  74.49 
 
 		 248 aa  384  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  74.07 
 
 		 243 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  68.72 
 
 		 248 aa  344  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  68.72 
 
 		 248 aa  343  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.49 
 
 		 240 aa  340  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  67.9 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  67.08 
 
 		 247 aa  332  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  67.62 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  69.16 
 
 		 248 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  68.03 
 
 		 244 aa  327  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  66.8 
 
 		 244 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  68.03 
 
 		 244 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  63.79 
 
 		 243 aa  323  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  66.26 
 
 		 246 aa  322  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5022  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.03 
 
 		 244 aa  321  6e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.670825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  65.02 
 
 		 246 aa  321  6e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5072  ABC transporter related  67.21 
 
 		 244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4896  ABC transporter related  67.21 
 
 		 244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0657003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  62.14 
 
 		 243 aa  318  5e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  65.43 
 
 		 240 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  62.14 
 
 		 249 aa  316  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  66.26 
 
 		 240 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  61.32 
 
 		 243 aa  315  4e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  61.73 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  61.98 
 
 		 249 aa  309  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  64.2 
 
 		 242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  62.14 
 
 		 244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  62.96 
 
 		 253 aa  308  4e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  58.85 
 
 		 242 aa  308  4e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.96 
 
 		 253 aa  308  6.999999999999999e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 242 aa  308  6.999999999999999e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  66.67 
 
 		 246 aa  307  8e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  60.08 
 
 		 242 aa  306  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  62.45 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.96 
 
 		 245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.96 
 
 		 284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  62.96 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  63.79 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60.91 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  60.49 
 
 		 242 aa  306  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.49 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  60.49 
 
 		 242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  58.02 
 
 		 244 aa  304  7e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  61.73 
 
 		 257 aa  303  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  60.49 
 
 		 240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  60.08 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  63.44 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  61.73 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  62.56 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  63.79 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 		 240 aa  301  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  60.08 
 
 		 243 aa  301  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  58.02 
 
 		 247 aa  301  5.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  61.32 
 
 		 246 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 		 240 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  60.08 
 
 		 243 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  61.32 
 
 		 243 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  59.09 
 
 		 247 aa  300  9e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  62.14 
 
 		 252 aa  300  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  59.67 
 
 		 242 aa  300  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3694  ABC transporter related  62.04 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.749012  normal  0.245017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  60.08 
 
 		 244 aa  299  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  60.08 
 
 		 240 aa  299  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  59.67 
 
 		 250 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  62.96 
 
 		 242 aa  299  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60.91 
 
 		 244 aa  299  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  60.08 
 
 		 252 aa  299  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  60.49 
 
 		 240 aa  299  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  62.96 
 
 		 239 aa  299  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  59.26 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  61.32 
 
 		 245 aa  298  4e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 		 240 aa  298  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.85 
 
 		 240 aa  297  8e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 		 240 aa  297  8e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.85 
 
 		 240 aa  297  8e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 		 240 aa  297  8e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  58.85 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  58.85 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  57.2 
 
 		 243 aa  297  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  60.08 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.26 
 
 		 244 aa  297  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  55.14 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  59.5 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  61.32 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  58.02 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  59.67 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.23 
 
 		 251 aa  295  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  59.67 
 
 		 242 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  58.44 
 
 		 258 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  60.91 
 
 		 240 aa  294  7e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 242 aa  294  8e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  62.39 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  59.67 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  63.44 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  59.26 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>