More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2403 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  82.88 
 
 		 447 aa  754    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  89.66 
 
 		 446 aa  834    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  82.17 
 
 		 458 aa  756    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  100 
 
 		 447 aa  919    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  84.12 
 
 		 448 aa  774    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  82.77 
 
 		 448 aa  766    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  52.94 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  53.49 
 
 		 416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  53.46 
 
 		 442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  53.48 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  52.77 
 
 		 434 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  52.27 
 
 		 443 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  51.67 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  50 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  51.92 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  48.59 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  52.42 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  52.27 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  52.28 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  46.1 
 
 		 427 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  42.52 
 
 		 427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  43.29 
 
 		 427 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  44.18 
 
 		 429 aa  346  6e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  44.55 
 
 		 978 aa  340  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  41.37 
 
 		 1016 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  42.08 
 
 		 1049 aa  316  5e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  42.08 
 
 		 1023 aa  316  6e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  42.38 
 
 		 1015 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  41.98 
 
 		 1018 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  41.41 
 
 		 1015 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  41.43 
 
 		 1015 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  42.32 
 
 		 413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  41.5 
 
 		 994 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  39.9 
 
 		 448 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  36.71 
 
 		 910 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1003 aa  280  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  36.38 
 
 		 966 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  36.47 
 
 		 976 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  36.58 
 
 		 973 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  36.98 
 
 		 981 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  36.6 
 
 		 973 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  36.89 
 
 		 970 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  36.98 
 
 		 981 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  36.98 
 
 		 981 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  41.4 
 
 		 427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  36.74 
 
 		 970 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  36 
 
 		 976 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  34.82 
 
 		 970 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  36.97 
 
 		 974 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  34.68 
 
 		 977 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  35.06 
 
 		 975 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  33.95 
 
 		 967 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  33.49 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  34.46 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  30.88 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  35.71 
 
 		 450 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  30.56 
 
 		 454 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  30.22 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  30.22 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  30.22 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  30.22 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  35.75 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  30.22 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  31.14 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  29.57 
 
 		 454 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  28.78 
 
 		 448 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  30.17 
 
 		 468 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  29.91 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  29.83 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  31.66 
 
 		 430 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  29.58 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  31.32 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  31.02 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  32.86 
 
 		 436 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  30.23 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  32.06 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  31.82 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  32.14 
 
 		 431 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  30.88 
 
 		 432 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  30.72 
 
 		 449 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  31.01 
 
 		 433 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  31.46 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  28.25 
 
 		 454 aa  177  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  30.68 
 
 		 430 aa  176  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  30.36 
 
 		 449 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  30.12 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  30.12 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  31.16 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  30.12 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  30.12 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  30.12 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  33.91 
 
 		 388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  31.26 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.91 
 
 		 388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  32.76 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  30.12 
 
 		 450 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  30.73 
 
 		 434 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1331  aminotransferase  31.26 
 
 		 451 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  30.12 
 
 		 450 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  30.12 
 
 		 450 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>