More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3789 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  74.45 
 
 		 778 aa  1170    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  74.45 
 
 		 778 aa  1170    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  85.95 
 
 		 789 aa  1346    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  75.16 
 
 		 778 aa  1177    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  79.39 
 
 		 778 aa  1239    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  79.51 
 
 		 778 aa  1241    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  75.03 
 
 		 778 aa  1177    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.45 
 
 		 778 aa  1170    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  79.39 
 
 		 778 aa  1239    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  74.45 
 
 		 778 aa  1170    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.45 
 
 		 778 aa  1170    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  75.16 
 
 		 778 aa  1177    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  89.35 
 
 		 779 aa  1424    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  58.85 
 
 		 785 aa  900    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.45 
 
 		 778 aa  1171    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  59.17 
 
 		 788 aa  911    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  82.03 
 
 		 779 aa  1278    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.45 
 
 		 778 aa  1170    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  75.16 
 
 		 778 aa  1177    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.45 
 
 		 778 aa  1169    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0924  aerobic respiration control sensor protein ArcB  45.58 
 
 		 753 aa  690    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178911  normal  0.270801 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  74.45 
 
 		 778 aa  1169    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3747  aerobic respiration control sensor protein ArcB  45.34 
 
 		 781 aa  658    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.244728  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00931  aerobic respiration control sensor protein ArcB  58.69 
 
 		 786 aa  917    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  85.95 
 
 		 789 aa  1364    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004463  aerobic respiration control sensor protein ArcB  59.29 
 
 		 784 aa  924    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135915  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  75.29 
 
 		 778 aa  1180    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01633  aerobic respiration control sensor protein ArcB  44.77 
 
 		 784 aa  673    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3645  aerobic respiration control sensor protein ArcB  76.28 
 
 		 777 aa  1184    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0208563  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  100 
 
 		 779 aa  1588    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0402  sensor histidine kinase  44.83 
 
 		 618 aa  425  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.928095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 965 aa  303  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 		 1199 aa  296  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1177 aa  294  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 		 882 aa  275  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1350 aa  272  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  33.66 
 
 		 984 aa  271  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 		 1204 aa  269  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 1222 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 1165 aa  265  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 877 aa  260  8e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 1226 aa  259  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  30.15 
 
 		 982 aa  258  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  32.03 
 
 		 794 aa  257  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 1596 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 		 827 aa  254  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 		 738 aa  253  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 		 1116 aa  253  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 		 982 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 873 aa  251  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  32.29 
 
 		 955 aa  250  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 764 aa  250  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 		 678 aa  249  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 		 1127 aa  249  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 902 aa  249  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 827 aa  248  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 		 1143 aa  248  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 		 1452 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 1059 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 		 916 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 		 1433 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1078 aa  245  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 939 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  32.21 
 
 		 987 aa  245  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3207  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 910 aa  244  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 957 aa  244  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 		 944 aa  244  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 969 aa  243  7.999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 947 aa  243  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  32.1 
 
 		 968 aa  242  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 		 817 aa  242  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 		 772 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 877 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 		 1195 aa  241  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 765 aa  241  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 		 876 aa  241  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 		 813 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 846 aa  239  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  30.45 
 
 		 630 aa  240  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  30.26 
 
 		 630 aa  239  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 631 aa  238  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 984 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  35.82 
 
 		 588 aa  237  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  37.78 
 
 		 882 aa  237  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.71 
 
 		 631 aa  236  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 781 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1340 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 947 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  36.03 
 
 		 578 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  32.18 
 
 		 787 aa  235  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 		 1313 aa  235  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 695 aa  235  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1933  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 650 aa  235  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77937  normal  0.846715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 785 aa  234  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 		 756 aa  234  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 863 aa  233  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  32.81 
 
 		 985 aa  233  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  35.62 
 
 		 1125 aa  233  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  31.21 
 
 		 1193 aa  232  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 895 aa  233  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>