More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2430 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 325 aa  668    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  80.25 
 
 		 324 aa  540  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  76 
 
 		 328 aa  495  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  74.46 
 
 		 328 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  68.52 
 
 		 327 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  68.52 
 
 		 327 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  68.52 
 
 		 327 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  67.28 
 
 		 324 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  66.67 
 
 		 328 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  66.67 
 
 		 328 aa  441  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  66.67 
 
 		 328 aa  441  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  66.67 
 
 		 328 aa  441  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  66.67 
 
 		 328 aa  441  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  66.67 
 
 		 328 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  66.67 
 
 		 328 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  66.67 
 
 		 328 aa  441  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  66.36 
 
 		 337 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  66.05 
 
 		 328 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  66.36 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  66.05 
 
 		 328 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  66.05 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  66.05 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  63.89 
 
 		 328 aa  423  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  44.62 
 
 		 328 aa  286  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  44.58 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  44.44 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  44.94 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  47.39 
 
 		 331 aa  248  8e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.54 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  43.51 
 
 		 336 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.44 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  39.18 
 
 		 351 aa  231  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  39.78 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  37.94 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  39.18 
 
 		 357 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  39.76 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  38.35 
 
 		 340 aa  222  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.36 
 
 		 365 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  37.82 
 
 		 360 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  37.85 
 
 		 370 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  38.38 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  38.38 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  38.1 
 
 		 368 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  42.04 
 
 		 333 aa  215  9e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  36.8 
 
 		 372 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  37.54 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  36.8 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  40.96 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  39.87 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  35.94 
 
 		 351 aa  209  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  36.98 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  38.75 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  36.49 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  37.58 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  39.24 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  35.06 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  31.4 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  35.31 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  34.37 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  31.07 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  33.13 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  33.54 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  33.66 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  35.56 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  32.42 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.33 
 
 		 323 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  30.29 
 
 		 369 aa  138  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  55.74 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  28.3 
 
 		 378 aa  132  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  45.83 
 
 		 190 aa  132  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  45.4 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  26.65 
 
 		 358 aa  129  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  36.71 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.2 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  32.26 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  31.72 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  30 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  30 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  30 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  30 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  29.27 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  30.41 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.09 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  37.66 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  30.4 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.6 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  35.22 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  25.88 
 
 		 363 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  33.51 
 
 		 365 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  26.07 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.82 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  33.16 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  26.77 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  32.85 
 
 		 380 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.27 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.27 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.16 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>