More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0556 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
204 aa  401  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  84.8 
 
 
230 aa  347  5e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  79.8 
 
 
204 aa  330  7.000000000000001e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  77.94 
 
 
204 aa  330  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  79.31 
 
 
204 aa  329  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  77.45 
 
 
204 aa  305  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  76.96 
 
 
204 aa  304  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  75.86 
 
 
204 aa  292  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  75.37 
 
 
222 aa  291  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  74.88 
 
 
204 aa  288  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  37.24 
 
 
210 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.69 
 
 
205 aa  134  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  38.95 
 
 
215 aa  131  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  38.61 
 
 
209 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  34.52 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.86 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  36.32 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  34.72 
 
 
205 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  41.18 
 
 
203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  40.32 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.32 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  40.32 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  39.13 
 
 
212 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  40.86 
 
 
203 aa  126  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 
205 aa  124  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 
212 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.68 
 
 
205 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
203 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 
209 aa  122  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  38.89 
 
 
205 aa  121  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 
211 aa  121  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  35.03 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  35.32 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  35.05 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  34.65 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 
214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  35.86 
 
 
212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  35.86 
 
 
212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 
204 aa  118  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  32.02 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  30.95 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  32.02 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  34.52 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  31.47 
 
 
213 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  33.86 
 
 
211 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  35.6 
 
 
204 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 
221 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  35.23 
 
 
204 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  32.49 
 
 
205 aa  111  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.12 
 
 
208 aa  111  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 
205 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.57 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.79 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  33.68 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 
219 aa  108  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  33.33 
 
 
208 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  35.27 
 
 
210 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  30.16 
 
 
222 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  31.86 
 
 
208 aa  104  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  31.02 
 
 
228 aa  104  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 
208 aa  104  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  32.37 
 
 
211 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.04 
 
 
234 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  32.37 
 
 
211 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.37 
 
 
211 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
214 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  32.37 
 
 
211 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  32.37 
 
 
211 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  38.27 
 
 
210 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  32.37 
 
 
211 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  34.3 
 
 
210 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.1 
 
 
211 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  31.84 
 
 
212 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  33.5 
 
 
204 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  31.37 
 
 
208 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  32.24 
 
 
218 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  35.03 
 
 
204 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  33.17 
 
 
206 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  33.17 
 
 
206 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1110  RhtB family transporter  30.15 
 
 
209 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  33.17 
 
 
206 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.94 
 
 
203 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  32.69 
 
 
211 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  28.14 
 
 
212 aa  101  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  32.5 
 
 
213 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  33.01 
 
 
206 aa  101  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  33.01 
 
 
206 aa  101  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  31.37 
 
 
208 aa  101  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  33.01 
 
 
206 aa  101  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 
211 aa  101  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  33.82 
 
 
210 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  33.82 
 
 
210 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>