More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3388 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 430 aa  870    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  67.91 
 
 		 430 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  57.11 
 
 		 429 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  55.08 
 
 		 436 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  55.32 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  45.92 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2314  homoserine dehydrogenase  48.74 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.848588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  43.36 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  47.03 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  42.46 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  43.03 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  41.76 
 
 		 436 aa  345  7e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  45.65 
 
 		 427 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  44.32 
 
 		 438 aa  341  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  43.2 
 
 		 439 aa  339  5e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 436 aa  338  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  41.78 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  41.81 
 
 		 436 aa  336  5.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  44.18 
 
 		 437 aa  334  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  42.09 
 
 		 428 aa  329  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  42.23 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  45.02 
 
 		 432 aa  329  5.0000000000000004e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  39.21 
 
 		 438 aa  329  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 		 431 aa  329  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  41.97 
 
 		 428 aa  328  9e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  42.29 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  39.63 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  41.97 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  41.97 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  41.97 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  41.57 
 
 		 436 aa  325  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 463 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  43.51 
 
 		 418 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  43.48 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  43.16 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  43.16 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  41.42 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 		 439 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  41.3 
 
 		 435 aa  323  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  41.74 
 
 		 437 aa  322  6e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  41.51 
 
 		 442 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 434 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  41.19 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  42.83 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  40.96 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  41.51 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  42.86 
 
 		 430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  40.85 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  39.76 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  41.46 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  39.76 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  42.48 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  39.52 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  39.52 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  40.09 
 
 		 447 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  42.48 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  41.73 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  42.24 
 
 		 439 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  41.28 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  39.52 
 
 		 431 aa  316  6e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 434 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  40.32 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  41.45 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  43.18 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  41.06 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  38.44 
 
 		 432 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  40.93 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 439 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  43.35 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  45.39 
 
 		 431 aa  310  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  43.76 
 
 		 441 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 		 449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  39.05 
 
 		 431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  38.81 
 
 		 431 aa  310  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  39.17 
 
 		 440 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  39.73 
 
 		 444 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  39.05 
 
 		 431 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  43.76 
 
 		 441 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  38.86 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  43.25 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  39.21 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  39.24 
 
 		 438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  39.21 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  43.76 
 
 		 441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  38.57 
 
 		 431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 436 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  41.08 
 
 		 449 aa  305  7e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 440 aa  305  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  38.33 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>