More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1705 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1705  Peptidase M23  100 
 
 		 360 aa  731    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2172  Peptidase M23  31.45 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2234  Peptidase M23  31.45 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.417932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7968  Peptidase M23  38.59 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0115  Peptidase M23  39.32 
 
 		 334 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4002  peptidase M23B  42.23 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2558  peptidase M23B  36.48 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  36.92 
 
 		 348 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  39.51 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  36.45 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  34.45 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  36.11 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  36.75 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  35.85 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0085  Peptidase M23  38.46 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  33.07 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  29.73 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  35.54 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  39.09 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  38.33 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  33.07 
 
 		 425 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  36.75 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  42.86 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  38.53 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  32.54 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  35.48 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  39.73 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  36.89 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  42.11 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  33.1 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  37.62 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  34.19 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  35.48 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  35.48 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  35.48 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  35.48 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  31.79 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  39.02 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  41.56 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  35.04 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  34.65 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  34.81 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  44.78 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  45.59 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  35.48 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  34.88 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1204  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0665885 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  32.48 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  33.83 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  37.01 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  42.57 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  34.19 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  35.04 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  35.04 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  47.83 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  37.25 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  34.19 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  41.67 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  34.19 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  31.62 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  37.14 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  34.19 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  33.01 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  34.19 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  30.95 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  34.19 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  47.95 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  34.19 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  37.3 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  37.5 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  50.7 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  35 
 
 		 399 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  35 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  34.19 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  32.39 
 
 		 472 aa  57  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  26.43 
 
 		 430 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  33.33 
 
 		 630 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  36.36 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  32.48 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  43.28 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  49.3 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  39.44 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  32.73 
 
 		 523 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  43.24 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  33.63 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  49.3 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  37.61 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  46.27 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  36.54 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  32.04 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0377  Peptidase M23  37.5 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1763  Peptidase M23  36.84 
 
 		 599 aa  56.6  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  36.59 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  31.08 
 
 		 465 aa  56.2  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  38.46 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  33.08 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  35.06 
 
 		 480 aa  56.2  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  47.14 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  40.54 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>