263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1109 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
242 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  61.33 
 
 
242 aa  277  9e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  60.61 
 
 
229 aa  258  7e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  54.85 
 
 
209 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  54.85 
 
 
209 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  60.1 
 
 
238 aa  245  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  50 
 
 
250 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  52.49 
 
 
264 aa  232  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  56.37 
 
 
239 aa  221  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  51.18 
 
 
225 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  41.59 
 
 
266 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  40.59 
 
 
258 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  48.4 
 
 
238 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  45.9 
 
 
207 aa  141  7e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  43.65 
 
 
320 aa  138  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  39.27 
 
 
623 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  47.68 
 
 
222 aa  131  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  38.92 
 
 
213 aa  131  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  49.66 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  44.38 
 
 
229 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  46.58 
 
 
325 aa  128  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  44.32 
 
 
206 aa  126  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  39.38 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.9 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  31.9 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  31.47 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  31.47 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  31.47 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  31.47 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  31.6 
 
 
236 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.12 
 
 
722 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  36.53 
 
 
192 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  39.74 
 
 
174 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  32.08 
 
 
236 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.12 
 
 
722 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  38.37 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  42.33 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  40.56 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  31.34 
 
 
207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  30.85 
 
 
213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  34.72 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  38.5 
 
 
232 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  38.5 
 
 
232 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  35.1 
 
 
226 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  32.69 
 
 
308 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  37.89 
 
 
704 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  34.83 
 
 
227 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  40.13 
 
 
228 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  32.39 
 
 
229 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.85 
 
 
717 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  37.09 
 
 
227 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  38.07 
 
 
236 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  41.18 
 
 
722 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  40.76 
 
 
224 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  30 
 
 
198 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  36.05 
 
 
185 aa  102  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.78 
 
 
746 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  34.9 
 
 
738 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  34.93 
 
 
224 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.07 
 
 
713 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  38.93 
 
 
149 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  37.36 
 
 
716 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  36.98 
 
 
233 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0621  hypothetical protein  29.85 
 
 
220 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  32.5 
 
 
200 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  40.3 
 
 
716 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  37.91 
 
 
717 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.86 
 
 
705 aa  97.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  38.93 
 
 
231 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  33.33 
 
 
713 aa  95.5  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  36.53 
 
 
231 aa  95.5  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  38.89 
 
 
232 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.12 
 
 
717 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  34.19 
 
 
224 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  42.48 
 
 
239 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  31.63 
 
 
198 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  43.79 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  36.67 
 
 
220 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  33 
 
 
230 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  38.38 
 
 
225 aa  89  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.25 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  37.76 
 
 
223 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.88 
 
 
214 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  37.5 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18721  hypothetical protein  32.12 
 
 
203 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  33.58 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.76 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  25.64 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  39.16 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  31.28 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  32.22 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  32.22 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  32.58 
 
 
246 aa  82  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.68 
 
 
712 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  38.71 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  35.2 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.54 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  30.12 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  31.75 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>