More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1794 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1794  CBS  100 
 
 
144 aa  295  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  47.22 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  37.86 
 
 
146 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  38.57 
 
 
140 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  38.71 
 
 
146 aa  89.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  37.5 
 
 
666 aa  83.2  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  33.58 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  33.64 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  37.9 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  36 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  39.39 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  38.14 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  40.4 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  40.57 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  40.4 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  37 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05140  conserved hypothetical protein  37.04 
 
 
704 aa  69.7  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  34.48 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  31.75 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  32.32 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  34.31 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  38.54 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29166  CBS domain-containing protein  36.08 
 
 
609 aa  69.3  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  34.34 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  34.34 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  37.9 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  40.4 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  38 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.87 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  29.41 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  34.41 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  31.16 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13833  predicted protein  35.09 
 
 
443 aa  67  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243831  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  30.63 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  39.39 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  37 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  39.39 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0896  putative signal transduction protein with CBS domains  38.79 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.711423 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  38.38 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  36.89 
 
 
611 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  38.38 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  29.71 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  36.07 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  31.73 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  34.31 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  38.38 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  38.78 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
625 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  35.35 
 
 
170 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  30.15 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 
618 aa  62.8  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  37.37 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  32.06 
 
 
606 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  37.37 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  36.63 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  34.86 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  33.58 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  32.06 
 
 
606 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  35.24 
 
 
286 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  31.37 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  32.76 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  30.51 
 
 
188 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  35.58 
 
 
615 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  30.36 
 
 
185 aa  61.6  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.03 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1166  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  34.09 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  36.21 
 
 
236 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  33.83 
 
 
606 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  34.48 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  29.91 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  31.93 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  36.7 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  30.25 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  36.09 
 
 
623 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  33.88 
 
 
615 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  31.53 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 
606 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  34.26 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  32.11 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  36.63 
 
 
615 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  30.63 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.19 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  36.19 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  33.64 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  31.45 
 
 
618 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  33.05 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  37.9 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  27.19 
 
 
614 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>