More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5628 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5628  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0980091  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5962  hypothetical protein  69.7 
 
 		 322 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1395  hypothetical protein  40.88 
 
 		 320 aa  215  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.107231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.74 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3341  hypothetical protein  39.07 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0035025  normal  0.828931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.61 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  37.54 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3438  hypothetical protein  38.51 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0699421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.03 
 
 		 327 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5677  hypothetical protein  37.58 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  37.33 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  38.19 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  38.75 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  37.33 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  36.22 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  36.75 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  34.8 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  37.42 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  40.58 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  35.14 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  35.62 
 
 		 343 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  35.84 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.84 
 
 		 330 aa  192  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.28 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.54 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.12 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  36.49 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  36.99 
 
 		 334 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.82 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  35.38 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.31 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  36.96 
 
 		 337 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.31 
 
 		 327 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  36.57 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  34.86 
 
 		 356 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  35.35 
 
 		 324 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.22 
 
 		 332 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  32.43 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  35.78 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  34.92 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  36.69 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  35.22 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  36.01 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  34.35 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.28 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  35.03 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  34.35 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  35.87 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  34.85 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  35.57 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  34.59 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  39.2 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  37.35 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  33.93 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  34.47 
 
 		 328 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  34.5 
 
 		 315 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  36.34 
 
 		 336 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  35.96 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  37.09 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  37.35 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  35.19 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  38.26 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  36.12 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.67 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  36.82 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  35.03 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  34.47 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  36.61 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  39.57 
 
 		 334 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  37.01 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  33.78 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  35.69 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1351  Fis family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  36.36 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  35.49 
 
 		 335 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  35.79 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.11 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  36.39 
 
 		 336 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  36.7 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  34.36 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  36.39 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  36.95 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  34.27 
 
 		 330 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  33.98 
 
 		 343 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  35.13 
 
 		 327 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  35.86 
 
 		 325 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.09 
 
 		 318 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  36.52 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  35.35 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3049  hypothetical protein  37 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  35.96 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  33.91 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  35.31 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1315  hypothetical protein  39.49 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  34.74 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  34.74 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  34.63 
 
 		 330 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0157  twin-arginine translocation pathway signal  35.81 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  34.8 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>