More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1408 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1408  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  76.83 
 
 		 331 aa  500  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  72.85 
 
 		 305 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  67.89 
 
 		 336 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  43.65 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.42 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.33 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  42.41 
 
 		 345 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  46.82 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  42.07 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42.95 
 
 		 337 aa  255  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.32 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  41.16 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.85 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.67 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  43.48 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  39.14 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.51 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.52 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  41.52 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.57 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.33 
 
 		 330 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.09 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  40.59 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.29 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  41.52 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.45 
 
 		 304 aa  242  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.84 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  41.39 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  42.57 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.05 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  41.28 
 
 		 321 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.95 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.54 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.95 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  40.26 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.24 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.32 
 
 		 328 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3532  hypothetical protein  40.07 
 
 		 341 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  41.95 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  40.95 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  39.7 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  40.27 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  40.13 
 
 		 339 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.28 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  38.75 
 
 		 320 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  40.67 
 
 		 346 aa  235  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40.6 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  39.87 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  39.88 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  38.23 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  40.91 
 
 		 366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.8 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.25 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.35 
 
 		 345 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  37.05 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.35 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.46 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  40.2 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  40.06 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.52 
 
 		 335 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.02 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  40.72 
 
 		 334 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  40 
 
 		 335 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  41.47 
 
 		 355 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  40.32 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  40.2 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.39 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  38.74 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.37 
 
 		 339 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  40.34 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  37.84 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  41.95 
 
 		 330 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  40.67 
 
 		 327 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  38.41 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.2 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  38.64 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  41.69 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.86 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  37.92 
 
 		 332 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.31 
 
 		 314 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.13 
 
 		 326 aa  229  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.47 
 
 		 327 aa  228  8e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  39.81 
 
 		 319 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  40.32 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.14 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.47 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  43.48 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.56 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  38.14 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.56 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  41.75 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  41.22 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.51 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  38.89 
 
 		 331 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.27 
 
 		 322 aa  226  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>