More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1595 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  93.31 
 
 		 344 aa  638    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  100 
 
 		 344 aa  701    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  92.44 
 
 		 357 aa  637    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  35.67 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  35.06 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  37.37 
 
 		 337 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  34.87 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  37.67 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  33.83 
 
 		 336 aa  189  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  36.51 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3618  ApbE family lipoprotein  38.71 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128321  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  33.76 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  33.88 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.23 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  33.88 
 
 		 348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  33.99 
 
 		 360 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  33.85 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  34.88 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  31.9 
 
 		 380 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2856  ApbE family lipoprotein  34.47 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  33.22 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  32.1 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  34.43 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4867  ApbE family lipoprotein  32.99 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.1173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6013  nitrous oxide reductase accessory protein NosX (required for nitrous oxide reduction), ApbE-like lipoprotein  33.93 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.279768  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  34.97 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1534  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 326 aa  149  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  31.97 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  33.8 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  32.13 
 
 		 366 aa  146  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1333  ApbE family lipoprotein  32.62 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.254528 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  31.91 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.87 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2356  ApbE family lipoprotein  31.17 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  33.79 
 
 		 355 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  31.07 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  33.88 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  32.08 
 
 		 337 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  32.44 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  31.01 
 
 		 351 aa  139  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  33.56 
 
 		 331 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  31.73 
 
 		 371 aa  136  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  31.54 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.52 
 
 		 336 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.39 
 
 		 343 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  34.33 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  33.44 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  33.44 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  31.39 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  30.89 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  30.48 
 
 		 348 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  31.82 
 
 		 346 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  29.57 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2415  ApbE family lipoprotein  32.62 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.410887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  31.13 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.98 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  31.27 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  30.94 
 
 		 340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  32.69 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.27 
 
 		 313 aa  129  6e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  30.91 
 
 		 338 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  29.84 
 
 		 353 aa  129  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  28 
 
 		 369 aa  129  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  27.99 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  32.42 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  30.74 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  32.47 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.01 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  32.08 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  29.67 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  31.6 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  29.04 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  31.65 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  34.06 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.36 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  31.29 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  30.79 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.08 
 
 		 341 aa  123  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  27.78 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 339 aa  122  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  27 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  31.6 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  26.92 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  29.19 
 
 		 346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  29.19 
 
 		 346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  30.1 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4341  ApbE family lipoprotein  31.28 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  27.65 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  29.73 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3326  hypothetical protein  34.21 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128315 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  30.18 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  30.99 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  30.18 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  31.98 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  27.71 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  31.98 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  31.98 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>