66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4293 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4293  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 239 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3627  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 87 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4734  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 82 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4414  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 		 99 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.514306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3774  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0502189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1799  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 103 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  27.37 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  30.53 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 74 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 74 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 322 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3770  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 81 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  32.39 
 
 		 374 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  30.99 
 
 		 374 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  30.99 
 
 		 374 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  30.99 
 
 		 374 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  30.99 
 
 		 374 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 374 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  30.99 
 
 		 374 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3572  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 121 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  53.85 
 
 		 610 aa  46.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3947  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 85 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  44.9 
 
 		 161 aa  45.8  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2433  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40389  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  42.86 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 300 aa  45.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4437  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 119 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672925  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 		 364 aa  45.4  0.0009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 374 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4790  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 96 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2380  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740526  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 		 368 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  29.58 
 
 		 374 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1020  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 103 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  41.18 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5367  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 119 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.216549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3537  transcriptional regulator, XRE family  42 
 
 		 97 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0177  putative DNA-binding repressor transcription regulator protein  29.23 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1709  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105629  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0283  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 102 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  40.91 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3074  helix-turn-helix type 3  48.94 
 
 		 131 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.620865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_264  hypothetical protein  44.19 
 
 		 76 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4878  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  48.72 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0928  hypothetical protein  35.29 
 
 		 127 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.729389  normal  0.315243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3172  XRE family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 94 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100844 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 108 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1608  XRE family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 108 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5021  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 147 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2219  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 146 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2276  XRE family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220665 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0552  transcriptional regulator, XRE family  41.86 
 
 		 71 aa  42.4  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.162215  hitchhiker  0.0000852105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6118  hypothetical protein  36.23 
 
 		 176 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0241909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  24.87 
 
 		 255 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0996  helix-turn-helix domain-containing protein  27.83 
 
 		 134 aa  42  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2500  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 69 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0317  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 103 aa  42  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0550269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4444  XRE family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 109 aa  42  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3065  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 98 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1042  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 102 aa  42  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5658  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 95 aa  42  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>