23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4878 on replicon NC_013442
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013442  Gbro_4878  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 181 aa  357  5e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5468  XRE family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.624713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  34.83 
 
 		 255 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5549  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361846  hitchhiker  0.00439273 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0557  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 89 aa  47.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 		 256 aa  45.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5451  XRE family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 374 aa  45.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5881  XRE family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5481  XRE family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4293  transcriptional regulator, XRE family  31.13 
 
 		 239 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 1381 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4294  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 374 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2219  helix-turn-helix domain-containing protein  30.56 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3572  transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 		 121 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  48.15 
 
 		 80 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  48.15 
 
 		 80 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  48.15 
 
 		 80 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  48.15 
 
 		 80 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  48.15 
 
 		 80 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  48.15 
 
 		 80 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 		 142 aa  41.2  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>