More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3253 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3253  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  100 
 
 
256 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.147547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  33.63 
 
 
320 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  36.49 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  35.59 
 
 
320 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  35.59 
 
 
320 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  35.59 
 
 
320 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  35.59 
 
 
320 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  35.59 
 
 
320 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.04 
 
 
321 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  36.04 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  36.04 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  36.04 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  36.04 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  36.04 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  36.04 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  36.04 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  36.04 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  33.76 
 
 
319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  33.76 
 
 
319 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  33.76 
 
 
319 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  33.76 
 
 
319 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  31.4 
 
 
319 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  31.4 
 
 
319 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  35.22 
 
 
320 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  31.84 
 
 
320 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  30.99 
 
 
319 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  29.75 
 
 
323 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  34.73 
 
 
328 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.85 
 
 
328 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  31.4 
 
 
319 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0419  biotin--protein ligase  29.63 
 
 
310 aa  106  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  33.48 
 
 
319 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  31.28 
 
 
319 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2427  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.67 
 
 
321 aa  102  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  28.91 
 
 
321 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  30 
 
 
317 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0077  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.54 
 
 
327 aa  102  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  32.07 
 
 
319 aa  101  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  28.69 
 
 
321 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  29.75 
 
 
319 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  29.63 
 
 
319 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  33.19 
 
 
319 aa  99.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  28.93 
 
 
319 aa  99  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  27.34 
 
 
320 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  29.39 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  29.34 
 
 
319 aa  97.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  28.69 
 
 
323 aa  96.7  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  28.69 
 
 
323 aa  96.7  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0032  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.87 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19089  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  27.63 
 
 
333 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0188  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.19 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1588  biotin--(acetyl-COA-carboxylase) synthetase  30.92 
 
 
326 aa  93.2  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0227  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.4 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00038256 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0847  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  27.63 
 
 
331 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  29.84 
 
 
320 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  30.25 
 
 
320 aa  91.3  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0086  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.55 
 
 
332 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0984  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.03 
 
 
335 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.381797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1418  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.48 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0102  biotin--protein ligase  33.05 
 
 
305 aa  89.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4226  biotin--protein ligase  32.1 
 
 
305 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  31.62 
 
 
331 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0788  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.17 
 
 
318 aa  87.8  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0490  biotin--protein ligase  32.1 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0887139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1326  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.77 
 
 
274 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.194167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  33.33 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0134  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.31 
 
 
326 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00373648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1971  biotin-(acetyl-CoA carboxylase) holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  32.79 
 
 
327 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0468  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.2 
 
 
247 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  33.74 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3953  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.75 
 
 
268 aa  85.9  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2840  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.19 
 
 
328 aa  86.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4629  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.06 
 
 
283 aa  85.9  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2431  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.82 
 
 
330 aa  85.1  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3003  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.48 
 
 
269 aa  85.1  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  29.88 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0935  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.24 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0177  biotin--protein ligase  29.63 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131379  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0244  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.35 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3720  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.98 
 
 
344 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.071565  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.11 
 
 
322 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0702  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.69 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0362526  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2459  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.71 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1903  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.3 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.37759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0073  biotin--protein ligase  31.51 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.702906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0263  biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase  34.07 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_002950  PG1601  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.5 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.495953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3341  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.43 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0204  biotin--protein ligase  39.31 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3992  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.43 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0505  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  40 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2045  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.71 
 
 
267 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0976  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.2 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  28.68 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  30.68 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06050  biotin--protein ligase  32.51 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2610  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.03 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.808481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2770  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.51 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1058  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.101759  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.39 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>