108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1697 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  100 
 
 		 172 aa  341  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  81.18 
 
 		 173 aa  288  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  79.07 
 
 		 173 aa  286  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  80.12 
 
 		 173 aa  283  5.999999999999999e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  80.12 
 
 		 173 aa  283  5.999999999999999e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  79.65 
 
 		 172 aa  280  7.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  79.07 
 
 		 172 aa  278  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  79.07 
 
 		 172 aa  278  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  76.74 
 
 		 172 aa  278  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  75.44 
 
 		 173 aa  268  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  71.51 
 
 		 172 aa  261  3e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  72.67 
 
 		 172 aa  261  4e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  62.21 
 
 		 172 aa  232  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  64.33 
 
 		 172 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  50.56 
 
 		 193 aa  177  7e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  49.44 
 
 		 178 aa  177  8e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  52.54 
 
 		 177 aa  174  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  50.54 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  49.16 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  48.91 
 
 		 184 aa  167  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  50.54 
 
 		 184 aa  167  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  48.88 
 
 		 179 aa  167  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  51.67 
 
 		 184 aa  163  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  47.25 
 
 		 182 aa  158  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  49.17 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  49.14 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  49.14 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  47.06 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  48.15 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  48.15 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  37.21 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  45.59 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  45.59 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  45.64 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  43.14 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  38.73 
 
 		 161 aa  117  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  39.76 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  39.76 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  43.9 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  41.91 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  42.86 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  38.55 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  37.95 
 
 		 161 aa  111  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  38.55 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  40.85 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  38.55 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  34.94 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  38.55 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  35.62 
 
 		 161 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  34.13 
 
 		 161 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  34.34 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  32.93 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  34.38 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  34.38 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  35.98 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  34.13 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  35.37 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  35.04 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  31.74 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  36.03 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  33.58 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  30.63 
 
 		 161 aa  94.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  30.63 
 
 		 161 aa  94.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  32.85 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  32.84 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  29.38 
 
 		 161 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  32.39 
 
 		 132 aa  88.2  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  32.58 
 
 		 175 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  32.5 
 
 		 170 aa  85.1  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  32.89 
 
 		 170 aa  84.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  32.89 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  25.43 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  25.81 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  25.93 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  23.31 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  30.51 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  29.91 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  25 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  28 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  27.55 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  23.84 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  23.23 
 
 		 1100 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  29.46 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  29.46 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  25.6 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  24.14 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  25.64 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  26.4 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  22.22 
 
 		 702 aa  48.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  25.89 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  21.38 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  21.32 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  26.79 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  26.79 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  27.1 
 
 		 913 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  25.89 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  42.86 
 
 		 705 aa  45.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  24.24 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  23.56 
 
 		 898 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  22.79 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>