126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2558 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  416  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  50.79 
 
 
204 aa  193  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  50.79 
 
 
204 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  45.88 
 
 
204 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0329  hypothetical protein  43.52 
 
 
233 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  41.49 
 
 
238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  42.93 
 
 
237 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  42.93 
 
 
237 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  42.93 
 
 
237 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  39.9 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  39.8 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  40.78 
 
 
205 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  40.88 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  38.55 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2330  hypothetical protein  40.8 
 
 
199 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  36.78 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  40.8 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  38.07 
 
 
198 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  38.07 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  37.56 
 
 
198 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  35.57 
 
 
195 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  35.38 
 
 
198 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  38.95 
 
 
211 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.85 
 
 
772 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  36.68 
 
 
211 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  36.32 
 
 
211 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  36.18 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  33.16 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  37.57 
 
 
205 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  34.34 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  35.03 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.31 
 
 
790 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.65 
 
 
789 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.51 
 
 
789 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.76 
 
 
781 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  35.98 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0110  hypothetical protein  37.66 
 
 
177 aa  92  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.97 
 
 
789 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  34.67 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.33 
 
 
761 aa  90.5  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  35.1 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  33.33 
 
 
757 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  38.62 
 
 
229 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.84 
 
 
752 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  36.36 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  36.36 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  37.97 
 
 
235 aa  86.3  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  33.33 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  34.34 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  33.5 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  35.5 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  34.36 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0918  hypothetical protein  30.12 
 
 
193 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  34.43 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  33.16 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  33.88 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  33.88 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  33.51 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  29.9 
 
 
211 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  31.94 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  33.16 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  34.22 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  33.16 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  31.43 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  31.5 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  31.58 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1328  hypothetical protein  32.35 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  33.85 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  31.53 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01230  hypothetical protein  27.43 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  33.9 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  32.82 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  32.8 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  29.74 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  30.53 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  32.82 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  32.49 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2656  hypothetical protein  30.59 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  32.62 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  29.19 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  29.1 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  28.49 
 
 
270 aa  64.7  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  31.09 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  31.91 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  29.28 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  31.25 
 
 
277 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  28.41 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  29.41 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  33.57 
 
 
179 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  28.98 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  30.89 
 
 
223 aa  62  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  27.27 
 
 
273 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  28.88 
 
 
270 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  31.38 
 
 
214 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  31.38 
 
 
214 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  31.38 
 
 
214 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  31.12 
 
 
278 aa  58.2  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  29.17 
 
 
235 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  28.93 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>