More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1000 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
278 aa  548  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  49.64 
 
 
275 aa  269  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 
264 aa  188  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 
267 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 
259 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  40.59 
 
 
269 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  35.27 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  36.22 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  32.97 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  34.42 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  31.39 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  32.37 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  34.97 
 
 
267 aa  129  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  34.04 
 
 
267 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  32.62 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  32.27 
 
 
280 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  32.17 
 
 
286 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  34.13 
 
 
296 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  37.43 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  32.73 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  37.89 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  30.82 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 
341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  37.95 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  37.95 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1424  phosphatidate cytidylyltransferase  31.16 
 
 
264 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.521758  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  32.89 
 
 
280 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  31.02 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  31.14 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  30.5 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.97 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  31.02 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  29.52 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  42.95 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3512  phosphatidate cytidylyltransferase  34.19 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0503603  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  29.03 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  40.98 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  34.88 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  32.63 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  32.56 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  29.63 
 
 
279 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  35.93 
 
 
289 aa  112  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  45.08 
 
 
272 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.2 
 
 
236 aa  112  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  28.21 
 
 
260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  30.11 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  36.46 
 
 
260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1045  phosphatidate cytidylyltransferase  31.21 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.447083  normal  0.0440857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  34.17 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  32.43 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  31.07 
 
 
262 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  32.73 
 
 
263 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  30.11 
 
 
263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  30.11 
 
 
263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  30.11 
 
 
263 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
281 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  32.88 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  40.83 
 
 
280 aa  108  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.5 
 
 
281 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  32.36 
 
 
276 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  38.5 
 
 
281 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  35.23 
 
 
310 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  30.36 
 
 
293 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  32.98 
 
 
270 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  28.37 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  28.37 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  29.51 
 
 
306 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  28.37 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.1 
 
 
211 aa  107  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  29.5 
 
 
283 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  28.27 
 
 
265 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
246 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
302 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  28.02 
 
 
266 aa  105  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  30.04 
 
 
277 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  40.24 
 
 
258 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
295 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  28.29 
 
 
306 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1922  phosphatidate cytidylyltransferase  30.65 
 
 
276 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  42.62 
 
 
280 aa  104  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 
268 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  30.53 
 
 
285 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  41.78 
 
 
216 aa  103  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 
296 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  35.71 
 
 
284 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  34.52 
 
 
298 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 
298 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 
287 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  34.52 
 
 
298 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 
298 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 
298 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  38.01 
 
 
275 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  31.51 
 
 
295 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 
281 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  31.51 
 
 
295 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  29.33 
 
 
273 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>