More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0872 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
260 aa  519  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.22 
 
 
260 aa  239  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.79 
 
 
264 aa  235  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.54 
 
 
266 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.85 
 
 
266 aa  234  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.95 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  49.81 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.37 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.04 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.37 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.99 
 
 
263 aa  229  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.77 
 
 
259 aa  228  7e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.38 
 
 
259 aa  227  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.82 
 
 
259 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.18 
 
 
264 aa  227  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.15 
 
 
260 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.59 
 
 
271 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.56 
 
 
266 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.56 
 
 
266 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.79 
 
 
270 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.45 
 
 
264 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.15 
 
 
261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.34 
 
 
267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
264 aa  221  9e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.36 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.93 
 
 
267 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.21 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.55 
 
 
266 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.58 
 
 
258 aa  218  6e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
265 aa  218  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.88 
 
 
259 aa  218  7e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.75 
 
 
270 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
266 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.53 
 
 
275 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.83 
 
 
269 aa  217  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  46 
 
 
265 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.79 
 
 
258 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
285 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.18 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.08 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.56 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.7 
 
 
267 aa  215  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.33 
 
 
268 aa  215  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  43.46 
 
 
268 aa  214  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.05 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.19 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.16 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.23 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.24 
 
 
268 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.72 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  46.64 
 
 
288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.35 
 
 
268 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.41 
 
 
268 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 
267 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.4 
 
 
266 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.97 
 
 
271 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.4 
 
 
271 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
266 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.37 
 
 
262 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 
273 aa  210  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.08 
 
 
278 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.02 
 
 
266 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.77 
 
 
267 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.31 
 
 
257 aa  208  6e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.41 
 
 
266 aa  208  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.97 
 
 
270 aa  208  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
259 aa  208  8e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.7 
 
 
258 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.42 
 
 
268 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.78 
 
 
270 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.45 
 
 
272 aa  206  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.52 
 
 
267 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 
261 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0835  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.53 
 
 
261 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303265  hitchhiker  0.00447803 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1323  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.8 
 
 
261 aa  206  4e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.98 
 
 
271 aa  205  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.24 
 
 
258 aa  205  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.21 
 
 
266 aa  205  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.74 
 
 
262 aa  205  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.13 
 
 
266 aa  204  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1409  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.41 
 
 
271 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.827257  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.27 
 
 
262 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.34 
 
 
276 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.75 
 
 
267 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1174  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.97 
 
 
262 aa  204  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.25 
 
 
258 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.33 
 
 
271 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.58 
 
 
295 aa  203  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.47 
 
 
256 aa  203  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.15 
 
 
288 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.2 
 
 
287 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.58 
 
 
262 aa  203  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.95 
 
 
263 aa  203  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.11 
 
 
262 aa  202  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.93 
 
 
285 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.93 
 
 
285 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
285 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.8 
 
 
278 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 
262 aa  202  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>