More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0288 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
369 aa  754    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  40.89 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  39.39 
 
 
565 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  42.57 
 
 
274 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  38.78 
 
 
275 aa  202  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 
273 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  40.88 
 
 
280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  37.88 
 
 
279 aa  199  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 
284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  36.23 
 
 
281 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  35.32 
 
 
277 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  36.8 
 
 
279 aa  189  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  36.5 
 
 
285 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  35.66 
 
 
276 aa  189  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  36.12 
 
 
285 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  38.33 
 
 
269 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  36.08 
 
 
277 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  36.12 
 
 
285 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  37.14 
 
 
269 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  36.12 
 
 
285 aa  185  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  37.75 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  38.74 
 
 
277 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  35.74 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  35.74 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  35.74 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  35.74 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  36.12 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  35.74 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  35.74 
 
 
285 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  36.75 
 
 
303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  35.69 
 
 
273 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  30.88 
 
 
285 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  34.96 
 
 
278 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  35.37 
 
 
269 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 
277 aa  179  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 
277 aa  179  9e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  36.75 
 
 
273 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  36.75 
 
 
273 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 
284 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  37.04 
 
 
274 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  37.18 
 
 
273 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  34.38 
 
 
288 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  34.1 
 
 
280 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  35.47 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  34.51 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  34.59 
 
 
271 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  31.18 
 
 
279 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  31.18 
 
 
277 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  31.14 
 
 
281 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  31.5 
 
 
281 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  30.77 
 
 
282 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  32.55 
 
 
274 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  32.77 
 
 
274 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  31.84 
 
 
275 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  30.5 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  31.76 
 
 
277 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  37.18 
 
 
1006 aa  157  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  30.86 
 
 
286 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 
256 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.45 
 
 
1008 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  34.51 
 
 
980 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0737  protein-glutamate O-methyltransferase  33.95 
 
 
270 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.730545  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  31.33 
 
 
269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.58 
 
 
993 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  29.28 
 
 
1160 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0259  protein-glutamate O-methyltransferase  33.71 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0177  protein-glutamate O-methyltransferase  32.45 
 
 
270 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  31.6 
 
 
1008 aa  139  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0471  MCP methyltransferase, CheR-type  31.27 
 
 
282 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  28.47 
 
 
852 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.742809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  30.56 
 
 
868 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.2 
 
 
1190 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0862  MCP methyltransferase, CheR-type  31 
 
 
272 aa  134  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0801  MCP methyltransferase, CheR-type  28.51 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.507771  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0987  protein-glutamate O-methyltransferase  33.86 
 
 
270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0956387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.93 
 
 
1215 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1104  protein-glutamate O-methyltransferase  32.1 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.849239  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0456  protein-glutamate O-methyltransferase  31.47 
 
 
250 aa  133  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0399  MCP methyltransferase, CheR-type  32.73 
 
 
820 aa  133  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.89 
 
 
1167 aa  132  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0941  MCP methyltransferase, CheR-type  30.97 
 
 
271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  28.39 
 
 
887 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1725  MCP methyltransferase, CheR-type  32.08 
 
 
270 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0695  protein-glutamate O-methyltransferase  33.19 
 
 
259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0717  MCP methyltransferase, CheR-type  30.52 
 
 
260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00142456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0433  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  28.73 
 
 
618 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  29.46 
 
 
631 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  33.74 
 
 
264 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.03 
 
 
1361 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0597  MCP methyltransferase, CheR-type  27.34 
 
 
481 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.66 
 
 
1371 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0370  protein-glutamate O-methyltransferase  29.2 
 
 
639 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.181962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1604  MCP methyltransferase, CheR-type  30.33 
 
 
260 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0143514  unclonable  1.76137e-23 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  32.31 
 
 
1399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3121  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  30.62 
 
 
617 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.805919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  30.04 
 
 
1010 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  30.51 
 
 
837 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.89 
 
 
1404 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.2 
 
 
1242 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.72 
 
 
1218 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>