More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6458 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6458  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 402 aa  833    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2348  FAD dependent oxidoreductase  45.89 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  42.39 
 
 		 401 aa  315  6e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3761  FAD dependent oxidoreductase  39.05 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4319  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 		 399 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05617  FAD dependent oxidoreductase, putative  37.16 
 
 		 417 aa  272  9e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0367368  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3195  oxidoreductase  38.21 
 
 		 405 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3172  oxidoreductase  38.46 
 
 		 405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3187  oxidoreductase, putative  37.18 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.70562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1670  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  36.6 
 
 		 427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1233  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1472  hypothetical protein  34.47 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1407  hypothetical protein  34.47 
 
 		 397 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3794  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 		 411 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1431  hypothetical protein  33.95 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3974  hypothetical protein  34.65 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1232  hypothetical protein  34.21 
 
 		 397 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1332  hypothetical protein  34.21 
 
 		 397 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1209  oxidoreductase  34.21 
 
 		 397 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1211  oxidoreductase  33.42 
 
 		 397 aa  209  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1370  hypothetical protein  34.12 
 
 		 398 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0253561  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0863  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 		 420 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4610  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  26.22 
 
 		 504 aa  95.5  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  24.94 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  25.36 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  24.88 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  25.12 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  25.12 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  25.12 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  25.12 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 		 466 aa  89.7  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 434 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 479 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  22.82 
 
 		 466 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 		 428 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 424 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  24.2 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 510 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  24.87 
 
 		 479 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  22.77 
 
 		 435 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  23.35 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  24.7 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  22.77 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 514 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  25.65 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  22.31 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  22.31 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  22.77 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  24.45 
 
 		 507 aa  83.6  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  22.31 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  21.83 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  22.51 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  26.58 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  22.6 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  20.88 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  21.87 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  21.93 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 513 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  22.4 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 513 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  22.98 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  23.31 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  21.91 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  23.31 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  22.6 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  22.84 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  22.92 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  23.22 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  22.59 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>