More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2162 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2162  ABC transporter related  100 
 
 		 327 aa  673    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.526088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0799  ABC transporter related protein  34.12 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2648  ABC transporter related  31.5 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3441  ABC transporter related  37.41 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0751  ABC transporter related  32.48 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0257  ABC transporter related  34.47 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  30.7 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  36.52 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2416  multiple sugar-binding ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.860941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  30.41 
 
 		 348 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  30.41 
 
 		 348 aa  169  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  34.68 
 
 		 330 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  30.61 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3171  ABC transporter related  29.82 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  33.54 
 
 		 370 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.88 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  32.55 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  32.35 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  32.15 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3243  ABC transporter related  29.86 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 		 349 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  30.75 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4913  ABC transporter related  32.29 
 
 		 383 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700005  normal  0.675349 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  32.7 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  29.45 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.56 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6575  ABC transporter related  34.68 
 
 		 356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66599  normal  0.677711 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  31.1 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  30.32 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  33.54 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  29.45 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  35.57 
 
 		 348 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  35.57 
 
 		 348 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5468  ABC transporter related  36.24 
 
 		 336 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6159  ABC transporter related  34.39 
 
 		 356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  35.57 
 
 		 348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  30.59 
 
 		 357 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  33.04 
 
 		 349 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4319  ABC transporter-related protein  31.42 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.34288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  31.89 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0630  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  30 
 
 		 372 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000125028  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.99 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  36.8 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  35.12 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.58 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  32.91 
 
 		 336 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  30.77 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  31.03 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  33.23 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  37.55 
 
 		 362 aa  159  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  33.44 
 
 		 368 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  34.98 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  35.31 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  31.41 
 
 		 357 aa  159  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  31.16 
 
 		 375 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  33.77 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  29.91 
 
 		 361 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.66 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  34.6 
 
 		 349 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1524  ABC transporter, ATP-binding protein  29.66 
 
 		 326 aa  159  8e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  32.38 
 
 		 355 aa  158  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  30.12 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  32.38 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  30.12 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  29.65 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  30.48 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.27 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  31.48 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  31.82 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.39 
 
 		 369 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  29.88 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  30.37 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  34.98 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  30.96 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.84 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  30.25 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.86 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  32.51 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  32.17 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  31.1 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  30.64 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  31.95 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.24 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.4 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  31.61 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  33.89 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1571  ABC transporter, ATP-binding protein  29.94 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.97 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  35.08 
 
 		 357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  31.88 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.39 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  30.28 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  31.95 
 
 		 330 aa  156  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  33.33 
 
 		 352 aa  155  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0202  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.77 
 
 		 351 aa  155  8e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  29.07 
 
 		 348 aa  155  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000472739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  29.94 
 
 		 330 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.23 
 
 		 351 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>