More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6575 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6159  ABC transporter related  95.79 
 
 
356 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217186 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6575  ABC transporter related  100 
 
 
356 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66599  normal  0.677711 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4913  ABC transporter related  77.27 
 
 
383 aa  567  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700005  normal  0.675349 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5401  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  73.6 
 
 
366 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  56.36 
 
 
349 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  52.75 
 
 
356 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  54.39 
 
 
352 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  53.28 
 
 
353 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  54.6 
 
 
352 aa  362  8e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  53.85 
 
 
355 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  52.71 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  53.43 
 
 
355 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  50.14 
 
 
351 aa  355  8.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  52.79 
 
 
357 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  53.11 
 
 
354 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  51.14 
 
 
355 aa  353  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  52.39 
 
 
354 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  51.56 
 
 
355 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  52.29 
 
 
354 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  50.96 
 
 
364 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  50.84 
 
 
358 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  50.99 
 
 
353 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  50.42 
 
 
353 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  50.69 
 
 
364 aa  349  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  52.26 
 
 
354 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  52.29 
 
 
357 aa  348  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  51.55 
 
 
361 aa  348  8e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.86 
 
 
350 aa  346  4e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  51.14 
 
 
353 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.14 
 
 
350 aa  345  8e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  51.57 
 
 
350 aa  345  8e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  51.42 
 
 
353 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  50.56 
 
 
360 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  51.41 
 
 
356 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  50.14 
 
 
356 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  49.59 
 
 
366 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  49.45 
 
 
366 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  52.34 
 
 
352 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  50 
 
 
360 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  50.28 
 
 
360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  51.43 
 
 
375 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  48.87 
 
 
355 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  51.14 
 
 
352 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  47.8 
 
 
373 aa  338  9e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  51.4 
 
 
356 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  50.28 
 
 
369 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  50.57 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  48.91 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  49.44 
 
 
360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  50.43 
 
 
352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.42 
 
 
365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  47.68 
 
 
372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  49.86 
 
 
355 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.12 
 
 
360 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  47.25 
 
 
369 aa  335  7.999999999999999e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.4 
 
 
381 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  48.91 
 
 
370 aa  334  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  47.58 
 
 
362 aa  333  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  49.86 
 
 
354 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  48.02 
 
 
331 aa  333  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  49.3 
 
 
366 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  50 
 
 
355 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  53.58 
 
 
359 aa  333  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  49.57 
 
 
364 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  49.58 
 
 
364 aa  332  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  50 
 
 
371 aa  332  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  49.86 
 
 
356 aa  332  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  49.72 
 
 
381 aa  332  6e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  50.57 
 
 
357 aa  332  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.71 
 
 
369 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  49.01 
 
 
358 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  50.42 
 
 
362 aa  331  9e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  49.59 
 
 
362 aa  331  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
381 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  48.89 
 
 
366 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 
364 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.29 
 
 
364 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  52.35 
 
 
365 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  48.04 
 
 
368 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  50.14 
 
 
356 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  49.86 
 
 
350 aa  330  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.04 
 
 
368 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.3 
 
 
349 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  49.44 
 
 
362 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5849  ABC transporter related  50.57 
 
 
352 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932892  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  48.88 
 
 
364 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  49.44 
 
 
379 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  50 
 
 
360 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.31 
 
 
363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  45.75 
 
 
370 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  49.72 
 
 
357 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  49.16 
 
 
358 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  49.86 
 
 
350 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  49.3 
 
 
357 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  46.74 
 
 
372 aa  328  7e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 
335 aa  328  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  49.31 
 
 
354 aa  328  8e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  48.03 
 
 
385 aa  328  9e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  49.44 
 
 
362 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>