More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3632 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3632  ABC transporter related  100 
 
 		 227 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.256668  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  39.32 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  39.32 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.05 
 
 		 642 aa  158  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  40.28 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  38.89 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  39.35 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  37.12 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.39 
 
 		 663 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  40.95 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  37.39 
 
 		 663 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  38.05 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.35 
 
 		 640 aa  152  5e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  40.2 
 
 		 1090 aa  152  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  39.58 
 
 		 280 aa  151  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  37.75 
 
 		 236 aa  151  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  38.29 
 
 		 668 aa  151  8e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  35.56 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  37.84 
 
 		 276 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  36.89 
 
 		 653 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  39.71 
 
 		 651 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  36.12 
 
 		 247 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4603  ABC transporter related  35.37 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.609954 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  37.23 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1933  hypothetical protein  35.11 
 
 		 236 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 654 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  39.32 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  37.78 
 
 		 222 aa  148  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  37.5 
 
 		 1130 aa  148  7e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  38.22 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  37.12 
 
 		 250 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1795  ABC transporter related protein  38.21 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  38.68 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  37.23 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  37.17 
 
 		 256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  38.1 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  36 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  37.83 
 
 		 654 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  36.12 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  34.96 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  35.75 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  36.15 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  38.36 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  37.99 
 
 		 654 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  38.83 
 
 		 885 aa  145  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  35.56 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  35.84 
 
 		 238 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.04 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  39.81 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  34.98 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  36.68 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.28 
 
 		 888 aa  144  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  36.97 
 
 		 653 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  36.44 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  35.24 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  36.02 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  38.96 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0967  ABC transporter related  37.82 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.205736  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1377  ABC transporter related  39.32 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  36.77 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  40 
 
 		 641 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  38.6 
 
 		 648 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2097  ABC transporter related protein  34.96 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.6 
 
 		 648 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.94 
 
 		 648 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  36.77 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2328  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705701  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  35.43 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  40.84 
 
 		 666 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  38.67 
 
 		 657 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  38.05 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.6 
 
 		 648 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.6 
 
 		 648 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.94 
 
 		 648 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  37.78 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2115  ABC transporter related  35.96 
 
 		 647 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  36 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.94 
 
 		 648 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  38.6 
 
 		 648 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.6 
 
 		 648 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  36.32 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  36.71 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  37.78 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 258 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  38.74 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.23 
 
 		 647 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.16 
 
 		 648 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  36.15 
 
 		 227 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  37.33 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  36 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0852  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  37.91 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  39.01 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  39.05 
 
 		 649 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  38.6 
 
 		 647 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>