64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2733 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 533 aa  1095    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 523 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 571 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 567 aa  66.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 549 aa  63.9  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 559 aa  63.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.64 
 
 		 520 aa  62  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.59 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  21.35 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 468 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  21.93 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1918  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 557 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 561 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.72 
 
 		 544 aa  51.6  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 451 aa  51.2  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 443 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  20.9 
 
 		 557 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 558 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.66 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  28.67 
 
 		 551 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 544 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.25 
 
 		 419 aa  48.9  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3591  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 421 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 435 aa  48.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 530 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.23 
 
 		 443 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 533 aa  47.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2569  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 523 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 536 aa  47  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 434 aa  47  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 		 522 aa  47  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  21.66 
 
 		 531 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  28.71 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  38.33 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 431 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 434 aa  45.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  22.01 
 
 		 366 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.13 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  31.13 
 
 		 445 aa  44.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 		 422 aa  44.3  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 446 aa  44.3  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0494  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 465 aa  44.3  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 436 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 541 aa  43.9  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 		 495 aa  43.9  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 422 aa  43.5  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 420 aa  43.5  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>