More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1055 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  100 
 
 		 554 aa  1117    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  32.3 
 
 		 577 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  30.63 
 
 		 572 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  30.12 
 
 		 546 aa  207  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  27.6 
 
 		 588 aa  206  1e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1056  ABC transporter related  30.41 
 
 		 546 aa  190  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000469517  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.39 
 
 		 529 aa  188  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  26.99 
 
 		 541 aa  183  6e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.4 
 
 		 524 aa  178  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1453  ABC transporter related  28.38 
 
 		 571 aa  164  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1498  ABC transporter related  28.38 
 
 		 571 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  28.46 
 
 		 563 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 		 616 aa  158  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  26.84 
 
 		 625 aa  159  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.15 
 
 		 581 aa  158  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  28.4 
 
 		 596 aa  157  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  24.79 
 
 		 595 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  26.95 
 
 		 590 aa  157  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  28.4 
 
 		 588 aa  156  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.22 
 
 		 597 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  26.95 
 
 		 590 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  27.18 
 
 		 571 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  29.05 
 
 		 564 aa  155  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  27.78 
 
 		 579 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.55 
 
 		 609 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.55 
 
 		 591 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  26.54 
 
 		 608 aa  154  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.22 
 
 		 597 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  26.95 
 
 		 609 aa  154  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  25.05 
 
 		 589 aa  153  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  25.61 
 
 		 571 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.75 
 
 		 555 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1367  ABC transporter related  25.53 
 
 		 610 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.3 
 
 		 582 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  24.36 
 
 		 595 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1351  ABC transporter related  25.34 
 
 		 610 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  30.45 
 
 		 566 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.45 
 
 		 566 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.51 
 
 		 579 aa  151  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1134  ABC transporter related protein  26.29 
 
 		 527 aa  151  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1608  ABC transporter related  25.36 
 
 		 600 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5675  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.23 
 
 		 601 aa  150  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400511  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1198  ABC transporter related  29.52 
 
 		 556 aa  150  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0109647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  35.37 
 
 		 577 aa  150  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.92 
 
 		 582 aa  150  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  35.37 
 
 		 577 aa  150  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0188  ABC transporter related  26.65 
 
 		 611 aa  149  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.55078  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  27.33 
 
 		 870 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0721  ABC transporter related  25.49 
 
 		 621 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.787703  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  29.86 
 
 		 578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  29.86 
 
 		 578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  25.05 
 
 		 526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1760  ABC transporter ATP-binding protein  24.81 
 
 		 610 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1466  ABC transporter related  29.02 
 
 		 572 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3954  ABC transporter related  24.81 
 
 		 610 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633219 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1507  ABC transporter related  29.02 
 
 		 572 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.112704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.51 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.68 
 
 		 577 aa  148  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.82 
 
 		 596 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.82 
 
 		 574 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.82 
 
 		 575 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  26.67 
 
 		 566 aa  147  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.82 
 
 		 596 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.82 
 
 		 574 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.82 
 
 		 575 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.82 
 
 		 575 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  25.94 
 
 		 595 aa  147  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.81 
 
 		 582 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.81 
 
 		 582 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.81 
 
 		 582 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.81 
 
 		 582 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.81 
 
 		 582 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.71 
 
 		 583 aa  146  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  27.59 
 
 		 607 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  25.6 
 
 		 603 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  25.19 
 
 		 581 aa  146  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  26.13 
 
 		 578 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  25.67 
 
 		 572 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  26.75 
 
 		 592 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  28.04 
 
 		 588 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.93 
 
 		 574 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.93 
 
 		 574 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  27.16 
 
 		 581 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  28.57 
 
 		 582 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.57 
 
 		 582 aa  145  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.37 
 
 		 571 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  145  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  145  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  24.25 
 
 		 582 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  145  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  145  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3192  ABC transporter related  27.44 
 
 		 701 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678636  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  28.57 
 
 		 582 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.37 
 
 		 582 aa  144  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.2758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  145  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  145  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  33.69 
 
 		 581 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  24.42 
 
 		 600 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.21 
 
 		 596 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  25.87 
 
 		 784 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>