173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1424 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1424  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
643 aa  1341    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3250  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.03 
 
 
651 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0167827  decreased coverage  0.00105641 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.28 
 
 
728 aa  340  7e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0397  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.72 
 
 
722 aa  336  1e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.571244  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1924  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.86 
 
 
664 aa  267  4e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234624  decreased coverage  0.00104389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.95 
 
 
762 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.75 
 
 
613 aa  140  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.85 
 
 
821 aa  137  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.11 
 
 
785 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.11 
 
 
905 aa  137  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.44 
 
 
812 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.38 
 
 
812 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  31.14 
 
 
736 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.49 
 
 
609 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.73 
 
 
781 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.02 
 
 
795 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  28.44 
 
 
777 aa  129  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 
515 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  35.44 
 
 
639 aa  126  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.86 
 
 
542 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.05 
 
 
790 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  26.86 
 
 
558 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.56 
 
 
618 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.07 
 
 
547 aa  124  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.49 
 
 
688 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.1 
 
 
665 aa  124  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.07 
 
 
816 aa  123  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.69 
 
 
525 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.39 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.45 
 
 
553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  33.47 
 
 
639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.33 
 
 
613 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.1 
 
 
794 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.1 
 
 
545 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  34.62 
 
 
602 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  28 
 
 
526 aa  120  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.78 
 
 
500 aa  120  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.23 
 
 
605 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.48 
 
 
797 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.72 
 
 
422 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.25 
 
 
766 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.98 
 
 
528 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.07 
 
 
529 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  31.23 
 
 
637 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.34 
 
 
634 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.25 
 
 
834 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.51 
 
 
593 aa  117  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 
584 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.29 
 
 
489 aa  117  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.47 
 
 
765 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.4 
 
 
688 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 
760 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  30.08 
 
 
795 aa  114  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.8 
 
 
505 aa  113  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  33.48 
 
 
503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.62 
 
 
779 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.54 
 
 
614 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.93 
 
 
534 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.72 
 
 
618 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.9 
 
 
549 aa  113  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.45 
 
 
534 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  32.08 
 
 
776 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.71 
 
 
683 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.04 
 
 
481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.02 
 
 
775 aa  111  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  32.4 
 
 
543 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.2 
 
 
546 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  27.9 
 
 
473 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 
527 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.12 
 
 
772 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7462  hypothetical protein  30.4 
 
 
449 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.29 
 
 
549 aa  107  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.65 
 
 
779 aa  107  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.48 
 
 
820 aa  107  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.06 
 
 
533 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.21 
 
 
811 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0232  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.65 
 
 
479 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107558  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.9 
 
 
866 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32069  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.45 
 
 
614 aa  105  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.6 
 
 
518 aa  103  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.05 
 
 
493 aa  103  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.76 
 
 
533 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.52 
 
 
655 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.07 
 
 
774 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.6 
 
 
673 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.68 
 
 
676 aa  101  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.55 
 
 
530 aa  100  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.12 
 
 
673 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.43 
 
 
913 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  28.31 
 
 
881 aa  99  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.48 
 
 
913 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  35.12 
 
 
1140 aa  98.6  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.48 
 
 
910 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  27.71 
 
 
778 aa  97.8  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.33 
 
 
525 aa  97.8  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  27.99 
 
 
807 aa  97.8  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 
915 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.89 
 
 
628 aa  97.4  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.07 
 
 
504 aa  97.4  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.09 
 
 
627 aa  96.3  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>