64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0997 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 279 aa  578  1e-164  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  56.27 
 
 		 280 aa  325  6e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  56.07 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  54.48 
 
 		 275 aa  321  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  55.2 
 
 		 283 aa  320  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  48.73 
 
 		 276 aa  286  2e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  34.42 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  33.69 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  33.69 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  33.33 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  32.85 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  32.12 
 
 		 276 aa  143  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  32.85 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  31.88 
 
 		 276 aa  142  7e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  31.75 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  33.46 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.44 
 
 		 276 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  29.83 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.83 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  31.29 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  30.94 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  31.73 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.22 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  30.53 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.7 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  32.32 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.2 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  25.32 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  26.21 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  26.21 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  26.7 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  26.61 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  25.25 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  30.64 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  27.65 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  27.45 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  27.49 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  24.88 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  25.98 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  23.77 
 
 		 304 aa  49.3  0.00006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3090  endonuclease IV  27.07 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.771432  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  28.29 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  31.78 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  27.17 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  22.67 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  36.36 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  26.9 
 
 		 298 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  25.74 
 
 		 280 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl333  endonuclease IV  24.88 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144036  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.85 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  28.78 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  28.93 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  24.51 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  24.89 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  48.98 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  28.69 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  21.21 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  27.27 
 
 		 282 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.12 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  25.76 
 
 		 277 aa  42.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  26.23 
 
 		 283 aa  42.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  22.22 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.9 
 
 		 264 aa  42.4  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>