More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3049 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  61.38 
 
 
778 aa  863    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  67 
 
 
803 aa  1025    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  66.49 
 
 
760 aa  900    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  56.95 
 
 
791 aa  721    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  55.99 
 
 
773 aa  730    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  68.88 
 
 
785 aa  1035    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  62.65 
 
 
760 aa  913    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.76 
 
 
790 aa  681    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
809 aa  1599    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  55.11 
 
 
807 aa  696    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  66.44 
 
 
768 aa  846    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  54.58 
 
 
817 aa  758    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  54.08 
 
 
769 aa  683    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.55 
 
 
806 aa  692    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3326  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.04 
 
 
813 aa  670    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172203  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  51.64 
 
 
798 aa  640    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  56.52 
 
 
771 aa  724    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.89 
 
 
811 aa  647    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  43.89 
 
 
778 aa  595  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  43.89 
 
 
778 aa  593  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.15 
 
 
762 aa  580  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  39.66 
 
 
777 aa  564  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  43.44 
 
 
772 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  44.11 
 
 
790 aa  547  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  42.73 
 
 
788 aa  537  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.16 
 
 
771 aa  532  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  44.19 
 
 
802 aa  515  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.27 
 
 
782 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.45 
 
 
760 aa  495  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.48 
 
 
795 aa  490  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.85 
 
 
783 aa  480  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.25 
 
 
755 aa  481  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
805 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.95 
 
 
902 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.8 
 
 
760 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.78 
 
 
756 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.73 
 
 
757 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  39.03 
 
 
789 aa  416  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  35.01 
 
 
743 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.45 
 
 
754 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  37.96 
 
 
808 aa  412  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  38.27 
 
 
793 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.576806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.5 
 
 
792 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  39.25 
 
 
811 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.61 
 
 
784 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.03 
 
 
807 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  39.92 
 
 
1037 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  37.06 
 
 
750 aa  385  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  36.34 
 
 
721 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  35.57 
 
 
772 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  34.91 
 
 
739 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  37.92 
 
 
738 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  32.41 
 
 
740 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.79 
 
 
751 aa  372  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.59 
 
 
801 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  36.88 
 
 
859 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02217  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  35.22 
 
 
759 aa  365  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.376318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  33.47 
 
 
743 aa  364  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.38 
 
 
751 aa  364  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.91 
 
 
752 aa  362  1e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  38.08 
 
 
737 aa  362  1e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.03 
 
 
804 aa  362  2e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  31.88 
 
 
766 aa  362  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.78 
 
 
723 aa  360  7e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.33 
 
 
799 aa  357  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.88 
 
 
766 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.88 
 
 
765 aa  352  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  36.73 
 
 
759 aa  350  5e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  34.52 
 
 
765 aa  350  5e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  36.98 
 
 
763 aa  347  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  33.71 
 
 
787 aa  347  6e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  34.76 
 
 
774 aa  346  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.29 
 
 
769 aa  346  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  35.33 
 
 
764 aa  343  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  31.52 
 
 
743 aa  342  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.56 
 
 
749 aa  342  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.79 
 
 
733 aa  342  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  36.61 
 
 
764 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  32.3 
 
 
751 aa  340  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.36 
 
 
702 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.44 
 
 
762 aa  338  2.9999999999999997e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  35.6 
 
 
723 aa  338  2.9999999999999997e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  34.34 
 
 
768 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  34.79 
 
 
763 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  33.04 
 
 
764 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  33.46 
 
 
765 aa  337  5e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.17 
 
 
759 aa  337  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  33.87 
 
 
727 aa  337  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  33.87 
 
 
727 aa  336  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  33.07 
 
 
759 aa  334  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  31.62 
 
 
745 aa  334  5e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  32.29 
 
 
763 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.97 
 
 
769 aa  331  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0331  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.47 
 
 
724 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398461  normal  0.549038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  33.92 
 
 
763 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  31.16 
 
 
765 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  31.03 
 
 
755 aa  328  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  33.92 
 
 
763 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  33.77 
 
 
763 aa  327  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  31.03 
 
 
755 aa  327  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>