232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02480 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_02480  Mg-dependent DNase  100 
 
 		 319 aa  658    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.03042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2262  TatD-related deoxyribonuclease  41.08 
 
 		 275 aa  185  9e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.225639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22950  Mg-dependent DNase  37.97 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00452809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0618  TatD-related deoxyribonuclease  32.09 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.189255 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4247  TatD-related deoxyribonuclease  28.96 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.555643  decreased coverage  0.000153731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1469  TatD-related deoxyribonuclease  27.74 
 
 		 249 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170381  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2208  TatD-related deoxyribonuclease  29.04 
 
 		 267 aa  99.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2878  TatD-related deoxyribonuclease  29.48 
 
 		 246 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.341938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0939  TatD-related deoxyribonuclease  26.92 
 
 		 249 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6142  TatD-related deoxyribonuclease  28.71 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0664  TatD-related deoxyribonuclease  25.85 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2311  TatD-related deoxyribonuclease  38.28 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3158  TatD-related deoxyribonuclease  26.12 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5067  TatD-related deoxyribonuclease  26.12 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5210  TatD-related deoxyribonuclease  26.97 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0522676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2167  TatD-related deoxyribonuclease  26.04 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1998  TatD-related deoxyribonuclease  22.31 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64467  predicted protein  29.84 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  23.73 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0199  TatD-related deoxyribonuclease  31.06 
 
 		 242 aa  57  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  28.89 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0198  TatD-related deoxyribonuclease  28.91 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.865826  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  27.98 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0212  TatD family deoxyribonuclease  28.91 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0222  TatD family deoxyribonuclease  28.91 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0256  putative deoxyribonuclease, TatD family  28.12 
 
 		 254 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  22.31 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  29.48 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  26.92 
 
 		 265 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  23.16 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  29.32 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  32.47 
 
 		 280 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  28.21 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  28.27 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  28.27 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  28.27 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1308  TatD-related deoxyribonuclease  25.97 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.700571  normal  0.456144 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  26.14 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  28.27 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  28.27 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  28.27 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  29.32 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0231  putative deoxyribonuclease, TatD family  27.34 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  29.32 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1177  hydrolase TatD family  23.47 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00325246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  25.17 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  30.77 
 
 		 264 aa  53.5  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  23.75 
 
 		 267 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  32.33 
 
 		 264 aa  53.1  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  28.43 
 
 		 264 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  33.86 
 
 		 260 aa  53.1  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  23.55 
 
 		 262 aa  53.1  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  23.55 
 
 		 262 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1040  TatD-related deoxyribonuclease  28.28 
 
 		 250 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  25.85 
 
 		 272 aa  52.8  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0202  TatD-related deoxyribonuclease  26.56 
 
 		 260 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  32.81 
 
 		 464 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2900  Mg-dependent DNase TatD  28.15 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000278617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  29.65 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  30.29 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  22.19 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  30.73 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5088  putative deoxyribonuclease, TatD family  25 
 
 		 254 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.279248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  24.65 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1431  TatD-related deoxyribonuclease  25.19 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  34.36 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  23.83 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  29.71 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  22.89 
 
 		 259 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  30.41 
 
 		 267 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  22.14 
 
 		 255 aa  50.1  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01260  cytoplasm protein, putative  21.54 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  31.48 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1299  TatD family hydrolase  24.22 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  22.26 
 
 		 264 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  36.36 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  27.12 
 
 		 267 aa  49.7  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  28.57 
 
 		 260 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0238  putative deoxyribonuclease, TatD family  24.22 
 
 		 254 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  23.26 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  27.62 
 
 		 270 aa  49.7  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  28.57 
 
 		 260 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  28.57 
 
 		 264 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  28.57 
 
 		 264 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  30.34 
 
 		 260 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  30.16 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2234  hydrolase, TatD family  30 
 
 		 268 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.291214 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  25.48 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  27.75 
 
 		 459 aa  49.3  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  32.56 
 
 		 273 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  25.91 
 
 		 264 aa  49.3  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  20.42 
 
 		 268 aa  49.3  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  23.55 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  26.98 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0199  TatD-related deoxyribonuclease  25.78 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  32.02 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  27.27 
 
 		 265 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02995  putative deoxyribonuclease  23.03 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537161  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  26.59 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  27.38 
 
 		 265 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>