62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3902 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3902  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  100 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.625639  normal  0.114917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  60.14 
 
 		 146 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0918  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  54.93 
 
 		 147 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0794  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  54.61 
 
 		 153 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  56 
 
 		 150 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  53.1 
 
 		 171 aa  147  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  56.85 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1180  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  55.94 
 
 		 148 aa  145  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  55.56 
 
 		 150 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  55.56 
 
 		 150 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  54.86 
 
 		 150 aa  141  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1823  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  54.35 
 
 		 147 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199401  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  52.14 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  49.63 
 
 		 144 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1693  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  52.9 
 
 		 154 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235962  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5974  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  52.35 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858735  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2478  hypothetical protein  53.57 
 
 		 146 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507905  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  49.63 
 
 		 144 aa  127  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1143  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  53.57 
 
 		 146 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0669271  normal  0.758995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1419  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  50.33 
 
 		 154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0819714  normal  0.118637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0271  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  47.45 
 
 		 145 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  52.86 
 
 		 146 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4295  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  55.17 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  51.43 
 
 		 141 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3713  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3459  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  56.93 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1425  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  58.27 
 
 		 148 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.987812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1992  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  56.2 
 
 		 147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129722  normal  0.402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1415  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  56.2 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2164  hypothetical protein  51.49 
 
 		 146 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1352  hypothetical protein  50.93 
 
 		 122 aa  107  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2116  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  55.47 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0732006  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1645  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  44.29 
 
 		 144 aa  99  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  43.88 
 
 		 137 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3057  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  35.29 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  33.59 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4018  hypothetical protein  33.83 
 
 		 373 aa  52  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0554525 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  33.83 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  32.76 
 
 		 242 aa  48.9  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  33.08 
 
 		 249 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  31.58 
 
 		 258 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  22.88 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  26.85 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  27.19 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  30.77 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  28.15 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  29.85 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  26.15 
 
 		 342 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  26.62 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  26.62 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  29.03 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  22.63 
 
 		 150 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4966  NLP/P60 protein  25.17 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  26.8 
 
 		 175 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  29.41 
 
 		 143 aa  42.4  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  28.8 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  29.91 
 
 		 327 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  25.55 
 
 		 225 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  25.55 
 
 		 226 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  25.16 
 
 		 267 aa  41.2  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  27.94 
 
 		 154 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  27.94 
 
 		 154 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>