260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3545 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3545  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 226 aa  440  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  52.65 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  45.33 
 
 		 220 aa  187  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  44.89 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  48.9 
 
 		 262 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  44.39 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  46.7 
 
 		 262 aa  185  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  43.24 
 
 		 220 aa  184  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  51.3 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  49.78 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  43.5 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  43.05 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  48.46 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  44.55 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  47.58 
 
 		 260 aa  181  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  48.02 
 
 		 262 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  48.92 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  52.61 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  50.44 
 
 		 232 aa  177  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  49.78 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  46.26 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  47.3 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  49.33 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2298  ribose 5-phosphate isomerase  52.36 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00166171  hitchhiker  0.00629248 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 230 aa  174  7e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  47.37 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2573  ribose 5-phosphate isomerase  52.36 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  46.52 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  44 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  48.46 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  47.77 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  48.05 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2254  ribose 5-phosphate isomerase  50.94 
 
 		 236 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  48.82 
 
 		 232 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2699  ribose 5-phosphate isomerase  57.07 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  44.34 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  43.81 
 
 		 224 aa  168  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4777  ribose 5-phosphate isomerase  53.95 
 
 		 235 aa  167  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485303  normal  0.318905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  48.44 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4669  ribose 5-phosphate isomerase  51.91 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.660296  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  47.79 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  42.73 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  41.48 
 
 		 233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  46.19 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  47.44 
 
 		 237 aa  164  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  47.19 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  48.05 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  46.52 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  46.72 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0120  ribose 5-phosphate isomerase  47.14 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  44.84 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  43.23 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0879  ribose 5-phosphate isomerase  46.49 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.0991517 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  46.78 
 
 		 236 aa  161  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0086  ribose-5-phosphate isomerase A  44.69 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  42.67 
 
 		 227 aa  159  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  43.05 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  42.52 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  44.54 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  46.7 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  43.06 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  42.67 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  41.89 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  45.07 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  41.96 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  42.29 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  42.29 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  42.29 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  42.29 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  42.29 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  42.29 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  42.29 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  42.29 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  42.29 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0825  ribose-5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  41.35 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  46.38 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3560  ribose-5-phosphate isomerase A  43.61 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  43.19 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  49.55 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0848  ribose-5-phosphate isomerase A  41.7 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.611603  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0436  ribose-5-phosphate isomerase A  41.59 
 
 		 219 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  44.35 
 
 		 250 aa  151  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3877  ribose-5-phosphate isomerase A  41.85 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1743  ribose-5-phosphate isomerase A  45.89 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1260  ribose-5-phosphate isomerase A  45.89 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1803  ribose-5-phosphate isomerase A  45.89 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1973  ribose-5-phosphate isomerase A  45.89 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0149  ribose-5-phosphate isomerase A  45.89 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689816  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1820  ribose-5-phosphate isomerase A  45.89 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1017  ribose-5-phosphate isomerase A  45.89 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0237346  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2364  ribose-5-phosphate isomerase A  43.5 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1221  ribose-5-phosphate isomerase A  49.34 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2516  ribose-5-phosphate isomerase A  45.45 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0426683  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1480  ribose-5-phosphate isomerase A  49.78 
 
 		 232 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2931  ribose-5-phosphate isomerase A  41.26 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195055  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  42.48 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>