More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0780 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0780  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0981369  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  60.4 
 
 
249 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  60.4 
 
 
248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  60.8 
 
 
248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  58.8 
 
 
248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  60 
 
 
248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  60.56 
 
 
248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  58.4 
 
 
248 aa  301  8.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  58.4 
 
 
248 aa  301  8.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  60.47 
 
 
253 aa  300  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  58 
 
 
248 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  60.96 
 
 
248 aa  298  6e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  59.36 
 
 
248 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  60 
 
 
248 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  57.48 
 
 
254 aa  295  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  59.6 
 
 
246 aa  295  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  59.6 
 
 
248 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  59.6 
 
 
248 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  59.2 
 
 
248 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  56.8 
 
 
248 aa  292  4e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  59.2 
 
 
248 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  61.2 
 
 
248 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  56.18 
 
 
248 aa  287  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  58 
 
 
246 aa  286  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  56.92 
 
 
255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  55.2 
 
 
248 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  59.36 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  59.13 
 
 
248 aa  280  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  60 
 
 
246 aa  276  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0345  hypothetical protein  55.78 
 
 
248 aa  266  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7401  hypothetical protein  57.2 
 
 
248 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372247  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  51.79 
 
 
249 aa  259  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1086  hypothetical protein  55.95 
 
 
249 aa  258  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  54.88 
 
 
253 aa  258  9e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6579  hypothetical protein  55.6 
 
 
248 aa  258  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2142  hypothetical protein  57.37 
 
 
247 aa  256  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68172  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3553  hypothetical protein  55.6 
 
 
248 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3062  hypothetical protein  58 
 
 
249 aa  254  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0946  hypothetical protein  53.78 
 
 
248 aa  251  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.596094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  53.78 
 
 
264 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0922  hypothetical protein  54.58 
 
 
248 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  50.59 
 
 
249 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  51.39 
 
 
243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  48.41 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  47.81 
 
 
247 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  47.83 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  45.42 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  45.82 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  49.01 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  45.42 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  45.82 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  47.04 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  47.43 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  48.37 
 
 
241 aa  212  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  47.62 
 
 
247 aa  211  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  44.84 
 
 
250 aa  210  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  46.64 
 
 
248 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  44.84 
 
 
250 aa  209  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  46.61 
 
 
247 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  47.79 
 
 
247 aa  209  5e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  48.36 
 
 
239 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  48.36 
 
 
239 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  47.41 
 
 
247 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  48.81 
 
 
248 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  47.01 
 
 
247 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  48.41 
 
 
248 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  48.41 
 
 
248 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  44.31 
 
 
250 aa  204  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  49.17 
 
 
245 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  47.13 
 
 
239 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  47.04 
 
 
248 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  47.22 
 
 
248 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_002978  WD0484  hypothetical protein  44.63 
 
 
246 aa  201  8e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  45.87 
 
 
246 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  45.42 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  45.45 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2210  hypothetical protein  49.19 
 
 
242 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495132  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  45.24 
 
 
246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  45.42 
 
 
239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  43.14 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  45.24 
 
 
246 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  44.84 
 
 
246 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  45.24 
 
 
246 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  48.78 
 
 
242 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  43.43 
 
 
248 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  44.84 
 
 
246 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  44.84 
 
 
246 aa  198  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  44.84 
 
 
246 aa  198  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  44.84 
 
 
246 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  44.84 
 
 
246 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  44.84 
 
 
246 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  44.84 
 
 
246 aa  198  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  44.84 
 
 
246 aa  198  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  44.84 
 
 
246 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  44.84 
 
 
246 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3203  hypothetical protein  47.08 
 
 
239 aa  198  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258342  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2332  hypothetical protein  49.19 
 
 
242 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.933086  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  45.42 
 
 
244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  44.27 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  45.12 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>