More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2332 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2332  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.933086  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2210  hypothetical protein  99.59 
 
 		 242 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2317  hypothetical protein  97.93 
 
 		 242 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.693566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1682  hypothetical protein  97.93 
 
 		 242 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.074172  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2294  hypothetical protein  97.93 
 
 		 242 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5621  hypothetical protein  97.52 
 
 		 242 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  96.69 
 
 		 242 aa  454  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1075  hypothetical protein  95.45 
 
 		 242 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1240  hypothetical protein  95.45 
 
 		 242 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0366087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0792  hypothetical protein  95.45 
 
 		 242 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166344  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1884  hypothetical protein  95.45 
 
 		 242 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1385  hypothetical protein  95.45 
 
 		 242 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0358  hypothetical protein  95.45 
 
 		 242 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1231  hypothetical protein  95.45 
 
 		 242 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1015  hypothetical protein  94.63 
 
 		 242 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  86.78 
 
 		 242 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  86.78 
 
 		 242 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2064  hypothetical protein  86.36 
 
 		 242 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2190  hypothetical protein  85.48 
 
 		 241 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2522  hypothetical protein  84.23 
 
 		 241 aa  394  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1988  hypothetical protein  82.57 
 
 		 241 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2388  hypothetical protein  82.57 
 
 		 241 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  76.99 
 
 		 240 aa  384  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0785  hypothetical protein  82.16 
 
 		 241 aa  384  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356846  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  71.97 
 
 		 239 aa  362  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  69.46 
 
 		 241 aa  352  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  67.93 
 
 		 239 aa  347  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  69.62 
 
 		 239 aa  347  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  69.62 
 
 		 239 aa  347  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  68.88 
 
 		 243 aa  345  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3203  hypothetical protein  68.62 
 
 		 239 aa  344  8e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  69.2 
 
 		 241 aa  344  8.999999999999999e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4067  hypothetical protein  69.04 
 
 		 241 aa  343  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.751245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2683  hypothetical protein  70.54 
 
 		 241 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0166157  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1967  hypothetical protein  68.62 
 
 		 243 aa  326  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2075  hypothetical protein  67.78 
 
 		 244 aa  322  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.967436  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2355  hypothetical protein  69.29 
 
 		 241 aa  322  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1728  hypothetical protein  66.8 
 
 		 241 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.359816 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1337  hypothetical protein  66.39 
 
 		 241 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4238  hypothetical protein  66.11 
 
 		 239 aa  314  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.800769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  61.98 
 
 		 250 aa  312  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  61.98 
 
 		 248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  61.57 
 
 		 247 aa  301  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  60.74 
 
 		 247 aa  301  9e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  59.92 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  59.92 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  59.5 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  62.4 
 
 		 248 aa  295  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  61.16 
 
 		 248 aa  295  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  61.98 
 
 		 248 aa  294  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  60.74 
 
 		 248 aa  293  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  60.33 
 
 		 248 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  60.33 
 
 		 248 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  62.14 
 
 		 249 aa  291  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  59.92 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  57.85 
 
 		 247 aa  289  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  59.92 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  59.92 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  59.5 
 
 		 246 aa  288  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  59.5 
 
 		 246 aa  288  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  59.5 
 
 		 246 aa  288  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  59.5 
 
 		 246 aa  288  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  59.5 
 
 		 246 aa  288  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  59.5 
 
 		 246 aa  288  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  57.85 
 
 		 247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  57.85 
 
 		 247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  60.74 
 
 		 246 aa  287  8e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  58.68 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  57.44 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  59.09 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  59.09 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  59.09 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  59.09 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  58.26 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  59.5 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  58.68 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  58.68 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  58.68 
 
 		 244 aa  283  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  57.85 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  57.85 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  58.68 
 
 		 244 aa  283  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  57.85 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  58.26 
 
 		 248 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  58.26 
 
 		 247 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2237  hypothetical protein  63.29 
 
 		 249 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  55.97 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  57.85 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  58.26 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  59.07 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  57.85 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  58.26 
 
 		 247 aa  278  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  57.44 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  60.33 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  59.84 
 
 		 250 aa  276  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  58.26 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  57.85 
 
 		 248 aa  275  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  59.92 
 
 		 248 aa  274  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  59.67 
 
 		 249 aa  274  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  59.92 
 
 		 248 aa  274  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  56.61 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>