More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1967 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1967  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  500  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1728  hypothetical protein  87.03 
 
 		 241 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.359816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  77.18 
 
 		 241 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3203  hypothetical protein  80.33 
 
 		 239 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2075  hypothetical protein  81.33 
 
 		 244 aa  390  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.967436  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  78.66 
 
 		 239 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  78.66 
 
 		 239 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  77.41 
 
 		 239 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2683  hypothetical protein  82.85 
 
 		 241 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0166157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4238  hypothetical protein  79.5 
 
 		 239 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.800769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  73.22 
 
 		 239 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1337  hypothetical protein  76.67 
 
 		 241 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  67.08 
 
 		 241 aa  348  5e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  67.5 
 
 		 240 aa  348  6e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4067  hypothetical protein  66.67 
 
 		 241 aa  343  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.751245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2522  hypothetical protein  67.5 
 
 		 241 aa  341  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  69.46 
 
 		 242 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  65.56 
 
 		 243 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  69.04 
 
 		 242 aa  337  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2190  hypothetical protein  67.78 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0785  hypothetical protein  66.67 
 
 		 241 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356846  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2332  hypothetical protein  68.62 
 
 		 242 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.933086  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  68.2 
 
 		 242 aa  332  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1988  hypothetical protein  67.78 
 
 		 241 aa  331  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2388  hypothetical protein  67.78 
 
 		 241 aa  331  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2210  hypothetical protein  68.62 
 
 		 242 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1231  hypothetical protein  68.2 
 
 		 242 aa  331  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0792  hypothetical protein  68.2 
 
 		 242 aa  331  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166344  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1884  hypothetical protein  68.2 
 
 		 242 aa  331  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1385  hypothetical protein  68.2 
 
 		 242 aa  331  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1075  hypothetical protein  68.2 
 
 		 242 aa  331  6e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1240  hypothetical protein  68.2 
 
 		 242 aa  331  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0366087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0358  hypothetical protein  68.2 
 
 		 242 aa  331  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1682  hypothetical protein  67.78 
 
 		 242 aa  329  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.074172  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2294  hypothetical protein  67.78 
 
 		 242 aa  329  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2317  hypothetical protein  67.78 
 
 		 242 aa  329  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.693566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2064  hypothetical protein  66.95 
 
 		 242 aa  329  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1015  hypothetical protein  68.2 
 
 		 242 aa  329  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5621  hypothetical protein  67.36 
 
 		 242 aa  327  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2355  hypothetical protein  67.08 
 
 		 241 aa  322  4e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  61.6 
 
 		 248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  58.58 
 
 		 250 aa  299  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  59.49 
 
 		 248 aa  294  7e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  58.23 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  58.05 
 
 		 248 aa  279  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  54.39 
 
 		 247 aa  279  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  54.81 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  57.26 
 
 		 247 aa  278  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  56.54 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  56.54 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  53.56 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2237  hypothetical protein  62.03 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  53.56 
 
 		 247 aa  271  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  56.96 
 
 		 248 aa  271  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  55.23 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  55.93 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  55.93 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  56.54 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  54.62 
 
 		 246 aa  268  8e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  53.14 
 
 		 247 aa  268  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  53.14 
 
 		 247 aa  268  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  55.42 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  55.23 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  54.39 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  54.39 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  54.39 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  52.72 
 
 		 247 aa  265  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  54.39 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  54.81 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  55.88 
 
 		 250 aa  264  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  53.97 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  53.97 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  53.97 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  53.97 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  53.16 
 
 		 247 aa  261  6e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  51.05 
 
 		 247 aa  261  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  53.56 
 
 		 248 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  53.97 
 
 		 248 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  53.14 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  53.14 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  53.14 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  53.81 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  52.72 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  52.74 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  52.72 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  52.72 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  53.56 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  52.72 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  52.72 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  53.56 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  52.72 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  53.14 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  53.56 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  54.66 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2018  protein of unknown function DUF28  58.23 
 
 		 245 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.687235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  52.72 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  53.97 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  55.46 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  53.56 
 
 		 248 aa  252  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  53.59 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>