More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2967 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 
162 aa  328  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  64.78 
 
 
168 aa  231  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  65.41 
 
 
168 aa  231  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  44.16 
 
 
155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  40.26 
 
 
262 aa  136  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  43.23 
 
 
156 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  43.23 
 
 
156 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  38.56 
 
 
266 aa  127  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  37.25 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  35.95 
 
 
300 aa  117  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  42.07 
 
 
172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  44.83 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  36.02 
 
 
160 aa  110  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  35.19 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 
158 aa  104  6e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  36.25 
 
 
195 aa  95.5  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  32.68 
 
 
177 aa  94.4  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  29.56 
 
 
185 aa  87.8  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  32 
 
 
190 aa  87.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  29.56 
 
 
190 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  29.56 
 
 
185 aa  87.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  44.44 
 
 
187 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  33.09 
 
 
162 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  45.24 
 
 
165 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  29.33 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  29.33 
 
 
190 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  48.68 
 
 
256 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  32.85 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  36.47 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  39.29 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  35.14 
 
 
351 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  40.26 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.43 
 
 
311 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  36.99 
 
 
330 aa  65.1  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.66 
 
 
316 aa  64.7  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  35.71 
 
 
243 aa  64.7  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  35.71 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  37.18 
 
 
342 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  35.29 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  27.71 
 
 
285 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  35.29 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  35.29 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  35.29 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  35.29 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  35.29 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  32.03 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  40 
 
 
370 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  28.68 
 
 
271 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  35.29 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  29.68 
 
 
211 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  40.54 
 
 
352 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  41.89 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  32.58 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  36.47 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  36.49 
 
 
316 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  40.28 
 
 
232 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  38.96 
 
 
372 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 
321 aa  61.6  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  28.81 
 
 
176 aa  61.6  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  38.96 
 
 
381 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  38.96 
 
 
372 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  41.1 
 
 
274 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  31.73 
 
 
275 aa  60.8  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  35.56 
 
 
434 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  35.56 
 
 
354 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2175  cytochrome c oxidase family protein  34.12 
 
 
141 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  38.67 
 
 
355 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  38.16 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  26.04 
 
 
280 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  35.56 
 
 
353 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  26.11 
 
 
314 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  31.52 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  30.26 
 
 
329 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  26.99 
 
 
249 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  36.84 
 
 
272 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  35.44 
 
 
370 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  31.36 
 
 
269 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 
362 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  42.19 
 
 
388 aa  58.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 
362 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  38.16 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  39.44 
 
 
330 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 
362 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  36.36 
 
 
352 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  36.49 
 
 
313 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4917  nitrous-oxide reductase  36.36 
 
 
646 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 
352 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  32.04 
 
 
302 aa  57.4  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
384 aa  57.4  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  35.06 
 
 
342 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  39.06 
 
 
377 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  32.58 
 
 
360 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  39.29 
 
 
647 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.94 
 
 
267 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
337 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  35.06 
 
 
338 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>