More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8605 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 354 aa  711    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6336  pentapeptide repeat-containing protein  35.09 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  30.81 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  29.2 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  32.42 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 411 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  27.15 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  27.6 
 
 		 493 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  33.46 
 
 		 433 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  35.69 
 
 		 418 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  30.56 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  36.82 
 
 		 298 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  32.86 
 
 		 416 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  38.96 
 
 		 204 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  38.62 
 
 		 521 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  25.29 
 
 		 489 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.85 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 		 567 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  33.89 
 
 		 903 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  33.54 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  32.5 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  40.71 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  38.57 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  37.32 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  37.59 
 
 		 199 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  36.64 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  32.14 
 
 		 734 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  37.41 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  35.82 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  40.87 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  39.16 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  39.04 
 
 		 179 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  34.4 
 
 		 710 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  35.42 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  36.76 
 
 		 900 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  33.55 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  34.62 
 
 		 866 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  37.01 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  20.86 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  35.48 
 
 		 180 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2142  pentapeptide repeat-containing protein  33.72 
 
 		 202 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  32.54 
 
 		 727 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  34.46 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  38.58 
 
 		 706 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  37.7 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  41.01 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  34.06 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  37.78 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  34.66 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  37.98 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  37.78 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  34.66 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  34.24 
 
 		 1033 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  34.15 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 		 441 aa  67  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  29.45 
 
 		 315 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  30.67 
 
 		 332 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  38.28 
 
 		 319 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  31.29 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  32.82 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  33.58 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  33.8 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  35.26 
 
 		 776 aa  66.2  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  34.75 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  32.82 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  35.56 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  35.56 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  32.82 
 
 		 401 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  35.46 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  35.66 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30.15 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30.15 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  27.54 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  34.48 
 
 		 216 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  36.23 
 
 		 862 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  32.82 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 165 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  36.43 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  35.42 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0745  pentapeptide repeat protein  36.54 
 
 		 971 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.888113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  36.89 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  34.93 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  30.89 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  38.03 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  32.17 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25.43 
 
 		 949 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  30.39 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  34.81 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  38.24 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  34.84 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  38.24 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  37.98 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  34.53 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  34.26 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  36.76 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  33.57 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  33.96 
 
 		 576 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1082  pentapeptide protein  36.75 
 
 		 614 aa  63.5  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0577925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>