More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6884 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  36.53 
 
 		 218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.42 
 
 		 224 aa  101  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.1 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  34.33 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.02 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  32.38 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.71 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.78 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  28.97 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  27.96 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  26.85 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.51 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.7 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  41.67 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  27.62 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  26.67 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  30.19 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.43 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  28.35 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  28.48 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  28.48 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  28.48 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  28.48 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  28.48 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  26.76 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  40.74 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1167  HAD superfamily hydrolase  30.73 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.484596  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  30 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  30 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.02 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  36 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  30 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  41.33 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2256  HAD family hydrolase  28.78 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00707302  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  32 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  32 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  28.29 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  32 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  35 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  32 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  32 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  32 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  32 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  32 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  32.63 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.61 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.94 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  31.03 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  32.41 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.61 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  28.95 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.34 
 
 		 133 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.5 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  40.68 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  25.69 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7390  predicted protein  28 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3961  HAD family hydrolase  29.77 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.65 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.27 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  23.73 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  22.92 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0949  HAD family hydrolase  43.18 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.06 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.16 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3605  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.94 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  40 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  35.24 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  32.17 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1676  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.67 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0608  HAD family hydrolase  36.14 
 
 		 259 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.675821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.29 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  33.03 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  34.91 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  22.92 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  22.92 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.48 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0810  HAD family hydrolase  32.67 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  21.5 
 
 		 224 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  33.03 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  30.57 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.17 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  21.88 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.61 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  29.59 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  34.18 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  32.56 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  29.29 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  40 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0361  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.14 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.751245  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  39.02 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1926  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.72 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  34.78 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>